Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Clec4n-202ENSMUST00000112554 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nop58Q6DFW4 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Nop58Q6DFW4 Gm11969-201ENSMUST00000118848 356 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Nop58Q6DFW4 Gm9670-201ENSMUST00000121201 540 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Nop58Q6DFW4 Gm14212-201ENSMUST00000122023 826 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Nop58Q6DFW4 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nop58Q6DFW4 Mir8099-2-201ENSMUST00000183568 127 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Nop58Q6DFW4 Mir8099-1-201ENSMUST00000184238 127 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Nop58Q6DFW4 Gm28645-201ENSMUST00000185859 564 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Nop58Q6DFW4 Gm28869-201ENSMUST00000187199 811 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nop58Q6DFW4 Gm29126-201ENSMUST00000188686 151 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Nop58Q6DFW4 Gm28401-202ENSMUST00000190769 550 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nop58Q6DFW4 Gm3841-201ENSMUST00000191399 451 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Nop58Q6DFW4 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Nop58Q6DFW4 Gm5857-201ENSMUST00000198953 493 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Nop58Q6DFW4 Gm44156-201ENSMUST00000203885 1189 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Nop58Q6DFW4 Gm44427-201ENSMUST00000204123 456 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nop58Q6DFW4 Clec4n-206ENSMUST00000205129 363 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nop58Q6DFW4 Gm45800-201ENSMUST00000210331 700 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nop58Q6DFW4 Gm32052-201ENSMUST00000212073 799 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nop58Q6DFW4 Gm4780-201ENSMUST00000213206 1242 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Nop58Q6DFW4 Gm46231-201ENSMUST00000220152 314 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Nop58Q6DFW4 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Nop58Q6DFW4 AC140288.1-201ENSMUST00000226329 503 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Nop58Q6DFW4 Acrbp-201ENSMUST00000032481 584 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nop58Q6DFW4 3110009E18Rik-202ENSMUST00000056038 401 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nop58Q6DFW4 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nop58Q6DFW4 Alox5ap-201ENSMUST00000071130 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nop58Q6DFW4 Lrrc51-201ENSMUST00000078448 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nop58Q6DFW4 Vmn1r196-201ENSMUST00000091735 906 ntAPPRIS P2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nop58Q6DFW4 1700007E05Rik-201ENSMUST00000186196 1513 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Nop58Q6DFW4 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nop58Q6DFW4 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nop58Q6DFW4 E330018M18Rik-201ENSMUST00000209455 1383 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nop58Q6DFW4 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nop58Q6DFW4 Depdc1a-202ENSMUST00000106041 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nop58Q6DFW4 Olfr92-202ENSMUST00000214994 2073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nop58Q6DFW4 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 Olfr976-201ENSMUST00000169307 2813 ntAPPRIS P2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 Gm23062-201ENSMUST00000102349 110 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 Mrps23-202ENSMUST00000107915 332 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 Armt1-202ENSMUST00000117489 680 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 Gm13858-201ENSMUST00000118862 671 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 Gm13038-201ENSMUST00000119886 459 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 Gm12911-201ENSMUST00000140639 703 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 Zfp652os-201ENSMUST00000155531 537 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 Gm17051-201ENSMUST00000170787 487 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 2010308F09Rik-202ENSMUST00000186931 578 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 C430002N11Rik-202ENSMUST00000189067 1029 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 Igkv8-34-201ENSMUST00000196959 365 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 Iglc1-201ENSMUST00000200568 454 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 Gm43699-201ENSMUST00000201312 818 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 Gm8921-201ENSMUST00000204306 649 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 Gm45509-201ENSMUST00000209624 1229 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 Gm45506-201ENSMUST00000211620 280 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 AC100209.1-201ENSMUST00000225562 409 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 Dnajb4-202ENSMUST00000050073 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 Dopey1-218ENSMUST00000190957 9187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 Hsp90aa1-201ENSMUST00000021698 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 Sntg1-210ENSMUST00000191683 4510 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 Gm2108-201ENSMUST00000165058 2177 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 Dcaf1-203ENSMUST00000161758 5539 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 Gm14329-201ENSMUST00000136027 591 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 4933411O13Rik-203ENSMUST00000146849 607 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 Gm10660-201ENSMUST00000148610 1203 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 Gm23031-201ENSMUST00000157998 119 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 Gm4252-201ENSMUST00000174823 313 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 Gm19705-204ENSMUST00000181524 413 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 Milr1-208ENSMUST00000183111 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 Gm38047-201ENSMUST00000193690 1133 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 Gm37339-201ENSMUST00000194142 392 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 Gm37929-201ENSMUST00000195116 493 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 Gm7565-201ENSMUST00000203611 623 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 Ctxn3-203ENSMUST00000209786 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 AC166052.1-201ENSMUST00000217028 397 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 AL713985.1-201ENSMUST00000219030 420 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 4933413J09Rik-201ENSMUST00000022427 899 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 Apoc2-201ENSMUST00000003074 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 Mir135b-201ENSMUST00000083501 97 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Nop58Q6DFW4 Dmrtc1c2-202ENSMUST00000087899 717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms