Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Trpm8-204ENSMUST00000171176 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm37076-201ENSMUST00000192033 2294 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Ica1l-206ENSMUST00000191251 3415 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Olfr537-ps1-201ENSMUST00000209871 2792 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Prrc2c-209ENSMUST00000182593 9022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm11961-201ENSMUST00000135775 1319 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm18726-201ENSMUST00000218175 2010 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Cd44-205ENSMUST00000111191 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 A230001M10Rik-203ENSMUST00000198712 1747 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Csde1-206ENSMUST00000197488 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 AC155243.1-201ENSMUST00000220141 2262 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 5430427O19Rik-201ENSMUST00000113976 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm4994-201ENSMUST00000118379 2187 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gip-201ENSMUST00000103156 607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gip-202ENSMUST00000103157 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm11907-201ENSMUST00000118918 1007 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Fyttd1-202ENSMUST00000120345 648 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm23657-201ENSMUST00000122623 294 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm15637-201ENSMUST00000135544 817 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm13421-202ENSMUST00000142511 803 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm6838-201ENSMUST00000172851 582 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm22649-201ENSMUST00000175134 298 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Magea2-203ENSMUST00000178950 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm8192-201ENSMUST00000182196 958 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Mir6340-201ENSMUST00000183857 119 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Mir7659-201ENSMUST00000184079 58 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm29273-201ENSMUST00000188880 262 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm28413-201ENSMUST00000189369 291 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 1700065J18Rik-202ENSMUST00000190576 387 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm37491-201ENSMUST00000192552 1111 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm42808-201ENSMUST00000198212 285 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm31243-202ENSMUST00000198354 628 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 D830044I16Rik-205ENSMUST00000206296 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm44984-201ENSMUST00000207802 394 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 9530078K11Rik-201ENSMUST00000208883 694 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 AC139568.1-201ENSMUST00000222878 486 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 AC154806.5-204ENSMUST00000228900 867 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Pcp4-201ENSMUST00000061739 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1412-202ENSMUST00000190505 3663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm21955-201ENSMUST00000194137 4968 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm15182-201ENSMUST00000120832 1676 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Poln-206ENSMUST00000202638 2814 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Glrx-201ENSMUST00000022082 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 AC121094.1-201ENSMUST00000224766 1345 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Creb5-212ENSMUST00000205120 7482 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm5175-201ENSMUST00000218458 1703 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm12763-201ENSMUST00000151344 1939 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm38366-201ENSMUST00000193127 1934 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Sorbs2-209ENSMUST00000132139 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm7265-201ENSMUST00000192735 3502 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Slc28a2-203ENSMUST00000110525 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Fryl-201ENSMUST00000094700 9852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Kcnmb2-205ENSMUST00000192429 2357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm45163-201ENSMUST00000207606 3987 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Mad2l1-202ENSMUST00000116605 7557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Fgb-201ENSMUST00000048246 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Mir99ahg-214ENSMUST00000183333 3422 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
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Sft2d1Q5SSN7 Son-205ENSMUST00000122302 2449 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 AC166574.5-201ENSMUST00000227438 1432 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Ros1-202ENSMUST00000218452 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Pls3-204ENSMUST00000114059 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm37245-201ENSMUST00000195137 2713 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gucy1b2-201ENSMUST00000022501 2711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Tor1aip2-202ENSMUST00000065648 2529 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Ube2v2-203ENSMUST00000115777 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm43864-201ENSMUST00000204452 4028 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Rhox4c-201ENSMUST00000115183 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm13573-201ENSMUST00000116410 631 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm13930-201ENSMUST00000118569 368 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Rbpsuh-ps1-201ENSMUST00000119456 1006 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm16267-201ENSMUST00000140569 732 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm15658-201ENSMUST00000148293 574 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm16143-201ENSMUST00000155982 538 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 5730435O14Rik-202ENSMUST00000170047 617 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm22408-201ENSMUST00000174925 65 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 2810429I04Rik-204ENSMUST00000185835 923 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Scgb2b30-201ENSMUST00000187013 336 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm29195-201ENSMUST00000189038 379 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Scgb2b10-201ENSMUST00000191403 318 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm37392-201ENSMUST00000192098 516 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
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