Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 4930553P18Rik-201ENSMUST00000201164 1659 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
D13Ertd608eQ3UPR8 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
D13Ertd608eQ3UPR8 1110008L16Rik-201ENSMUST00000021411 3122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Mad2l1-202ENSMUST00000116605 7557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnj16-206ENSMUST00000180023 3701 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm29502-201ENSMUST00000185979 3739 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc12a8-205ENSMUST00000122314 2819 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Rasgef1b-210ENSMUST00000209346 3028 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp1r3b-201ENSMUST00000070481 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Myrfl-201ENSMUST00000048229 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm28819-202ENSMUST00000187416 1335 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Lyz2-201ENSMUST00000092163 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgap15-203ENSMUST00000112824 3118 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Etnppl-202ENSMUST00000163620 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
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D13Ertd608eQ3UPR8 Ighv9-2-201ENSMUST00000103472 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrps18c-202ENSMUST00000112898 460 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Rfc4-203ENSMUST00000115338 1279 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
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D13Ertd608eQ3UPR8 Mgst1-203ENSMUST00000120230 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
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D13Ertd608eQ3UPR8 Scnm1-201ENSMUST00000172572 1054 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
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D13Ertd608eQ3UPR8 4931403E22Rik-201ENSMUST00000177048 668 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Mir6974-201ENSMUST00000184381 83 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
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D13Ertd608eQ3UPR8 1600019K03Rik-201ENSMUST00000187829 477 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm36667-201ENSMUST00000196125 753 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
D13Ertd608eQ3UPR8 1700094M23Rik-201ENSMUST00000197695 695 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gpn1-206ENSMUST00000202394 631 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm32688-201ENSMUST00000213849 585 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm34263-201ENSMUST00000214010 352 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
D13Ertd608eQ3UPR8 AC166822.1-201ENSMUST00000227667 636 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Cst13-201ENSMUST00000046589 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Cldn10-202ENSMUST00000071546 1031 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
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D13Ertd608eQ3UPR8 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
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D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Adgrg6-203ENSMUST00000208429 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Prox1-202ENSMUST00000175916 7913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Dopey1-218ENSMUST00000190957 9187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Psg21-202ENSMUST00000182128 2066 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Pank1-202ENSMUST00000112460 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Obox6-201ENSMUST00000108513 1344 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Gramd1c-204ENSMUST00000214098 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Ncoa6-201ENSMUST00000043126 6872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Gykl1-201ENSMUST00000066193 1990 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrps23-202ENSMUST00000107915 332 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Fgf2-203ENSMUST00000108120 526 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15616-201ENSMUST00000118662 375 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5319-201ENSMUST00000118965 873 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12630-201ENSMUST00000121575 784 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
D13Ertd608eQ3UPR8 2810403D21Rik-201ENSMUST00000123040 601 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmbim6-203ENSMUST00000159531 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
D13Ertd608eQ3UPR8 1700025N21Rik-201ENSMUST00000160997 686 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm24307-201ENSMUST00000178512 101 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms