Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 4921521D15Rik-201ENSMUST00000197578 1927 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Frmpd4-202ENSMUST00000112146 8153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Wnk1-218ENSMUST00000161512 1426 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Scn3a-201ENSMUST00000066432 9560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm10568-201ENSMUST00000193244 1634 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Fam114a1-201ENSMUST00000031080 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Zzz3-202ENSMUST00000106100 7607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Tmem173-201ENSMUST00000115728 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Adgrl3-211ENSMUST00000120128 6370 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Q3U6N9 AC122769.1-201ENSMUST00000226930 1714 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Zfp128-202ENSMUST00000144578 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Tmed5-201ENSMUST00000002837 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Q3U6N9 C79798-201ENSMUST00000131588 1793 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Grm8-203ENSMUST00000115324 3299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Vmn1r44-212ENSMUST00000228183 1838 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Crnn-203ENSMUST00000195515 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Acod1-201ENSMUST00000022722 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Plch1-202ENSMUST00000059973 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Zkscan5-202ENSMUST00000085671 3794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm25760-201ENSMUST00000103989 132 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Ap3s1-ps1-201ENSMUST00000117113 579 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm13732-201ENSMUST00000117753 535 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm6142-201ENSMUST00000120290 325 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm12804-201ENSMUST00000121030 999 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm22275-201ENSMUST00000122470 310 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Eif4e1b-203ENSMUST00000126785 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Q3U6N9 1700086P04Rik-201ENSMUST00000149472 1009 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Smarcal1-207ENSMUST00000152225 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm23207-201ENSMUST00000158665 102 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm6264-201ENSMUST00000160802 624 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Arpp19-204ENSMUST00000167885 540 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Ap3s1-ps2-201ENSMUST00000178107 579 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Q3U6N9 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm38022-201ENSMUST00000191762 403 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm2860-201ENSMUST00000199226 707 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm42723-201ENSMUST00000199966 1044 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Olfr622-204ENSMUST00000216570 2149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Olfr922-201ENSMUST00000051004 1132 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm10307-201ENSMUST00000189839 1337 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm37022-201ENSMUST00000192517 2254 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Olfr212-203ENSMUST00000220134 2349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Q3U6N9 AC154270.2-201ENSMUST00000226755 2306 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm37535-201ENSMUST00000194442 2365 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Peak1-204ENSMUST00000188142 7524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Q3U6N9 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Nae1-211ENSMUST00000162466 1735 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Amy1-202ENSMUST00000106540 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Nt5c1b-220ENSMUST00000223534 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Olfr480-202ENSMUST00000217653 1876 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Vmn1r44-213ENSMUST00000228700 2004 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Olfr1441-203ENSMUST00000216506 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Q3U6N9 AC159301.1-202ENSMUST00000225860 2133 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Vmn2r45-201ENSMUST00000164845 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Rbms3-212ENSMUST00000174868 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Tmem161b-206ENSMUST00000225069 2414 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm13083-201ENSMUST00000105773 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Itgb3bp-204ENSMUST00000146258 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Q3U6N9 A330076C08Rik-201ENSMUST00000220765 5020 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Q3U6N9 AC154347.1-201ENSMUST00000221358 3105 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Liph-202ENSMUST00000074230 3703 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Liph-201ENSMUST00000060673 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Krtap9-5-201ENSMUST00000105052 1077 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm15123-201ENSMUST00000138988 339 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Mgst2-203ENSMUST00000159554 486 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Mup8-202ENSMUST00000163931 986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Obox3-204ENSMUST00000173912 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm25617-201ENSMUST00000179548 133 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm8357-201ENSMUST00000181115 1011 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm8245-201ENSMUST00000182434 987 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm19480-201ENSMUST00000185547 667 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm28117-201ENSMUST00000188472 371 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm29566-201ENSMUST00000190627 457 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm37526-201ENSMUST00000194640 619 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm5050-201ENSMUST00000197164 775 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm25617-202ENSMUST00000198387 132 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm21054-201ENSMUST00000203981 380 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm29154-205ENSMUST00000213325 1112 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm34552-201ENSMUST00000223381 636 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Q3U6N9 AC133598.3-204ENSMUST00000224260 767 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Q3U6N9 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Dzank1-204ENSMUST00000163701 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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