Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp2c66-201ENSMUST00000087234 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Tm9sf4-201ENSMUST00000089027 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15638-203ENSMUST00000154775 2945 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Phc1-208ENSMUST00000160696 4213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43982-201ENSMUST00000204995 1829 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccndbp1Q3TVC7 AC161595.1-201ENSMUST00000216389 1993 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Il1a-201ENSMUST00000028882 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxw21-203ENSMUST00000198076 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Slco1a4-201ENSMUST00000032364 2252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Scn1a-202ENSMUST00000094951 5946 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Ubtfl1-202ENSMUST00000164441 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccndbp1Q3TVC7 AC158988.1-201ENSMUST00000226731 2624 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1392-207ENSMUST00000217275 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Scaper-201ENSMUST00000037408 5158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Itih5-201ENSMUST00000026886 7900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Uba1y-202ENSMUST00000190013 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Muc5b-201ENSMUST00000165147 14964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Meis2-206ENSMUST00000110908 3697 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Nif3l1-201ENSMUST00000087521 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7091-201ENSMUST00000116438 586 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14248-201ENSMUST00000117790 544 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl22-ps1-201ENSMUST00000118652 386 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13163-201ENSMUST00000119875 336 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22206-201ENSMUST00000158612 116 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm19585-201ENSMUST00000186007 587 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Ighv1-38-201ENSMUST00000192755 349 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37328-201ENSMUST00000193191 640 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38328-201ENSMUST00000195582 317 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43192-201ENSMUST00000198002 637 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccndbp1Q3TVC7 4933431C10Rik-201ENSMUST00000208973 1266 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr587-ps1-202ENSMUST00000209201 477 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm35024-201ENSMUST00000213359 972 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm34424-201ENSMUST00000213400 782 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3428-204ENSMUST00000214488 1020 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Akr1c12-201ENSMUST00000021632 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7986-201ENSMUST00000221336 551 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8075-202ENSMUST00000223088 682 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccndbp1Q3TVC7 CT009711.4-201ENSMUST00000225685 198 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Klk1b8-201ENSMUST00000072204 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20900-201ENSMUST00000078729 472 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15229-201ENSMUST00000146636 1398 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccndbp1Q3TVC7 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29220-201ENSMUST00000185862 1501 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28966-201ENSMUST00000188951 1501 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Cdk14-204ENSMUST00000115452 1567 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccndbp1Q3TVC7 Soat1-207ENSMUST00000189661 8371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccndbp1Q3TVC7 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr525-202ENSMUST00000214594 5137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6011-201ENSMUST00000211736 1796 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Trim12c-202ENSMUST00000130139 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9268-201ENSMUST00000166914 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn2r62-201ENSMUST00000169130 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9268-202ENSMUST00000173815 2565 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43398-201ENSMUST00000196584 2742 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp438-201ENSMUST00000063989 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37372-201ENSMUST00000193577 3311 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43606-201ENSMUST00000195938 3556 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Ogfod1-203ENSMUST00000109556 5310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1346-203ENSMUST00000215302 4525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd36-202ENSMUST00000109856 4491 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Enpep-201ENSMUST00000029658 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccndbp1Q3TVC7 5430427O19Rik-201ENSMUST00000113976 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Cept1-202ENSMUST00000068301 2814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn2r88-201ENSMUST00000022438 2574 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Cfap74-203ENSMUST00000105619 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccndbp1Q3TVC7 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Virma-202ENSMUST00000059914 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp2b23-201ENSMUST00000077356 2189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15093-201ENSMUST00000179021 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Prkd3-201ENSMUST00000003191 5517 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1239-202ENSMUST00000216762 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Slc38a6-202ENSMUST00000101313 1546 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14280-201ENSMUST00000138080 1444 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16506-201ENSMUST00000165553 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Ogdh-203ENSMUST00000093350 4075 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccndbp1Q3TVC7 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr602-ps1-201ENSMUST00000118403 948 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6461-201ENSMUST00000120015 633 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13525-201ENSMUST00000120607 478 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccndbp1Q3TVC7 4930599N23Rik-201ENSMUST00000146981 880 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Mir3072-201ENSMUST00000175610 83 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Mir1231-201ENSMUST00000175639 81 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Ank3-228ENSMUST00000182692 3833 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Mir8094-201ENSMUST00000183361 117 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29230-201ENSMUST00000189687 412 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18752-201ENSMUST00000192876 608 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44096-201ENSMUST00000203171 504 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms