Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Matr3-215ENSMUST00000190121 2638 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Ccdc82-206ENSMUST00000217444 4736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm42568-201ENSMUST00000195639 1841 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Patj-203ENSMUST00000102792 3755 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Strada-203ENSMUST00000106867 3386 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Kcnj15-207ENSMUST00000113861 3385 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 AC164623.1-201ENSMUST00000217947 2709 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 AC105407.2-205ENSMUST00000224680 2733 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Ate1-208ENSMUST00000216011 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm2108-201ENSMUST00000165058 2177 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Carf-206ENSMUST00000180952 2157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm37937-201ENSMUST00000194130 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Brd8-201ENSMUST00000003876 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Olfr1232-202ENSMUST00000213860 2413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Tpmt-202ENSMUST00000110118 881 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm12635-201ENSMUST00000117285 752 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm11895-201ENSMUST00000122165 467 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Trav8-2-201ENSMUST00000130122 337 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm25640-201ENSMUST00000175378 125 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 0610031O16Rik-204ENSMUST00000185122 825 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Mir8097-201ENSMUST00000185150 119 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 1700028E10Rik-206ENSMUST00000202216 557 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 5033423K11Rik-202ENSMUST00000202802 1162 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Olfr976-203ENSMUST00000217360 1164 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 AC108947.1-201ENSMUST00000224274 1000 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 3110018I06Rik-201ENSMUST00000082269 1005 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Trip4-210ENSMUST00000179395 7055 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Zmat3-201ENSMUST00000029199 7797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Ncoa2-202ENSMUST00000068304 8006 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm8180-201ENSMUST00000163599 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm3327-201ENSMUST00000168906 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm42969-201ENSMUST00000199858 3631 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm44289-201ENSMUST00000204144 1390 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Tmc2-201ENSMUST00000077988 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 4930480K23Rik-201ENSMUST00000180465 3326 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 4930524O08Rik-201ENSMUST00000183387 1451 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Olfr1508-202ENSMUST00000206520 5791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Meis2-206ENSMUST00000110908 3697 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Cxcr4-201ENSMUST00000052172 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm28867-201ENSMUST00000190194 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Lingo2-202ENSMUST00000098151 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Olfr460-202ENSMUST00000216942 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Cabyr-204ENSMUST00000121018 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Glrx-201ENSMUST00000022082 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Il12a-201ENSMUST00000029345 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Olfr1085-202ENSMUST00000213279 5191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm42648-201ENSMUST00000200774 2505 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Ceacam2-203ENSMUST00000066503 3140 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Smad5-202ENSMUST00000109874 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Dbhos-201ENSMUST00000150024 4020 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Olfr348-202ENSMUST00000213498 3540 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 A630072L19Rik-202ENSMUST00000221309 1519 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Nadk-201ENSMUST00000030939 2946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Nyap2-202ENSMUST00000113494 4540 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Igkv8-21-201ENSMUST00000103387 382 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Ighv9-1-201ENSMUST00000103471 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Ighv9-2-201ENSMUST00000103472 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps123-201ENSMUST00000110449 237 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm13798-201ENSMUST00000118285 139 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm13156-201ENSMUST00000118348 321 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm12844-201ENSMUST00000119463 582 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm11338-201ENSMUST00000120086 1160 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm12321-201ENSMUST00000121485 804 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm23888-201ENSMUST00000122690 253 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Olfr636-ps1-201ENSMUST00000134827 935 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm13362-201ENSMUST00000137186 839 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm13982-201ENSMUST00000138372 755 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 4930517O19Rik-201ENSMUST00000140320 603 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm22882-201ENSMUST00000157749 124 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Slc25a5-ps-201ENSMUST00000162199 826 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm2619-202ENSMUST00000166777 651 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm3208-201ENSMUST00000168281 427 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Dctd-206ENSMUST00000174379 381 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm24824-201ENSMUST00000175097 78 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm24157-201ENSMUST00000175265 111 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm26784-201ENSMUST00000181666 410 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm27178-201ENSMUST00000184962 340 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Lax1-202ENSMUST00000189524 628 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm28644-201ENSMUST00000191364 585 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm4856-201ENSMUST00000192696 1091 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm3549-201ENSMUST00000203873 794 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm32884-201ENSMUST00000205528 732 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm18655-201ENSMUST00000214802 1090 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 AC133598.3-204ENSMUST00000224260 767 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 CT009527.2-201ENSMUST00000225386 606 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 n-R5s41-201ENSMUST00000083025 119 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Tnfrsf22-202ENSMUST00000084396 564 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Olfr417-201ENSMUST00000085862 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Ide-201ENSMUST00000131070 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Itpr1-205ENSMUST00000203615 9761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Hsd3b2-202ENSMUST00000107022 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Prokr2-201ENSMUST00000049997 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Csrnp3-201ENSMUST00000053910 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Olfr472-201ENSMUST00000209670 5290 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Vwa3a-205ENSMUST00000167213 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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