Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm15093-201ENSMUST00000179021 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Lrrc51-206ENSMUST00000106966 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Mobp-203ENSMUST00000111627 481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm15422-201ENSMUST00000117453 541 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm13163-201ENSMUST00000119875 336 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm15092-201ENSMUST00000138467 574 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 AW495222-202ENSMUST00000149839 868 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm25164-201ENSMUST00000158908 116 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Nrbf2-202ENSMUST00000159002 583 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Vwc2l-204ENSMUST00000162182 1195 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r-ps18-201ENSMUST00000176901 876 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 1810022K09Rik-202ENSMUST00000185384 435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm28285-204ENSMUST00000187793 601 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 1700020D05Rik-201ENSMUST00000189704 1021 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm37349-201ENSMUST00000194205 624 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm18484-201ENSMUST00000204389 991 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Smarcad1-215ENSMUST00000205118 600 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Akr1c12-201ENSMUST00000021632 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 AC159462.2-201ENSMUST00000217559 463 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Atp8b3-202ENSMUST00000219648 524 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm45925-202ENSMUST00000219904 1136 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm19011-201ENSMUST00000221777 808 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 AC069562.1-201ENSMUST00000224206 434 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 CT009539.1-201ENSMUST00000226465 220 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Rida-201ENSMUST00000022946 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Ppbp-201ENSMUST00000031319 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 1700001C19Rik-202ENSMUST00000073143 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Rpl31-ps20-201ENSMUST00000080982 378 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 B230118H07Rik-201ENSMUST00000090513 969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 AC129085.2-201ENSMUST00000223763 2800 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Siae-202ENSMUST00000213126 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gen1-201ENSMUST00000166117 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Cd44-206ENSMUST00000111192 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm11855-201ENSMUST00000121562 1869 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Cabyr-207ENSMUST00000191078 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Coro2a-203ENSMUST00000107757 4124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 4933424M12Rik-201ENSMUST00000132609 1944 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm13346-201ENSMUST00000135767 3634 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Morc1-201ENSMUST00000023330 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm31181-201ENSMUST00000217731 2283 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm8212-201ENSMUST00000166350 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Olfr859-202ENSMUST00000212540 9532 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 2610044O15Rik8-202ENSMUST00000186619 2337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Zeb2-213ENSMUST00000176732 1762 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 4931406B18Rik-201ENSMUST00000013497 3970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 CT010470.1-201ENSMUST00000225364 1876 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm22439-201ENSMUST00000104048 132 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 n-R5s9-201ENSMUST00000104432 117 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Trappc2-201ENSMUST00000112192 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
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Rpusd3Q14AI6 Tbata-208ENSMUST00000143207 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Tvp23bos-201ENSMUST00000148598 1011 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm13427-201ENSMUST00000154296 794 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
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Rpusd3Q14AI6 Gm28164-201ENSMUST00000190143 442 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 AF067063-202ENSMUST00000195234 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm30613-201ENSMUST00000197277 512 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 A730082K24Rik-202ENSMUST00000205795 658 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm8077-201ENSMUST00000209221 1024 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm36435-201ENSMUST00000213341 1178 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 AC134859.1-201ENSMUST00000214085 721 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 AC166052.1-201ENSMUST00000217028 397 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm36719-201ENSMUST00000219518 927 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 AC158535.1-201ENSMUST00000221487 769 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 CT010472.1-201ENSMUST00000224000 704 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Wfdc10-201ENSMUST00000094344 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 2610020C07Rik-201ENSMUST00000181526 2925 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Olfr691-202ENSMUST00000213290 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Usp17lc-201ENSMUST00000079348 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 AC158938.1-201ENSMUST00000225372 6720 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm15930-201ENSMUST00000156603 2037 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm45061-201ENSMUST00000204395 2095 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm9256-201ENSMUST00000198106 1420 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms