Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Gm13663-202ENSMUST00000145563 643 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Tvp23bos-201ENSMUST00000148598 1011 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm28573-201ENSMUST00000187821 380 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm28416-201ENSMUST00000188334 292 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm28145-201ENSMUST00000189742 380 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm28400-201ENSMUST00000191332 380 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm37225-201ENSMUST00000193423 325 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Ghrl-207ENSMUST00000204533 323 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Mplkip-202ENSMUST00000221480 582 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 AC166822.1-201ENSMUST00000227667 636 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Cldn10-202ENSMUST00000071546 1031 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm24924-201ENSMUST00000084007 164 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Hba-a2-201ENSMUST00000093207 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 AC159624.1-201ENSMUST00000217762 1344 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 4933406C10Rik-202ENSMUST00000181670 1633 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 AC093022.3-201ENSMUST00000226569 1926 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Vmn1r90-201ENSMUST00000185220 7144 ntAPPRIS P2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Wfdc8-203ENSMUST00000109339 3227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Olfr671-203ENSMUST00000217091 3225 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Cep112it-201ENSMUST00000143781 4813 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 AC132465.2-201ENSMUST00000218673 2728 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Zfp239-207ENSMUST00000172088 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm28856-201ENSMUST00000189150 2828 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Vmn2r88-201ENSMUST00000022438 2574 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Impg2-204ENSMUST00000160116 3992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Trav13n-4-201ENSMUST00000103634 267 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Lrrc51-203ENSMUST00000106963 835 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm13038-201ENSMUST00000119886 459 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm24139-201ENSMUST00000122780 288 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Ccdc142os-201ENSMUST00000125657 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm10913-201ENSMUST00000133732 463 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm24647-201ENSMUST00000157112 113 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Slc29a1-208ENSMUST00000164769 1226 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm20111-201ENSMUST00000184830 319 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 4931428L18Rik-203ENSMUST00000187659 423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm3103-201ENSMUST00000198073 752 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm19175-201ENSMUST00000199895 916 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm5723-201ENSMUST00000203096 432 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm39075-201ENSMUST00000206031 512 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm9240-201ENSMUST00000206527 742 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm33467-201ENSMUST00000221885 652 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm10197-201ENSMUST00000086887 201 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm45528-201ENSMUST00000209854 3145 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm3139-203ENSMUST00000202642 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Glrx-201ENSMUST00000022082 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 CT025639.1-201ENSMUST00000223906 1375 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Sema6a-202ENSMUST00000076043 4123 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm14762-201ENSMUST00000105109 1771 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Tctex1d1-202ENSMUST00000116317 1772 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm3460-201ENSMUST00000167882 1809 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm7978-201ENSMUST00000178552 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm45876-201ENSMUST00000212698 2709 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm37896-201ENSMUST00000195611 2791 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm42653-201ENSMUST00000200644 2839 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm26945-201ENSMUST00000183191 2011 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm5702-201ENSMUST00000185629 2469 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 5830416I19Rik-201ENSMUST00000198687 2627 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Tmem209-202ENSMUST00000102991 1718 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Birc6-223ENSMUST00000183224 14562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Zeb2-213ENSMUST00000176732 1762 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm25276-201ENSMUST00000104300 124 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm7129-201ENSMUST00000117402 997 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm13840-201ENSMUST00000149608 256 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm11816-202ENSMUST00000149848 714 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Casp12-204ENSMUST00000151332 1065 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Mgst2-206ENSMUST00000161590 481 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Nedd8-202ENSMUST00000163750 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Olfr759-ps1-201ENSMUST00000174238 700 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm17973-201ENSMUST00000174509 520 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Mir5100-201ENSMUST00000174993 64 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Smarca2-210ENSMUST00000176475 983 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm27458-201ENSMUST00000185108 121 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm18254-201ENSMUST00000185699 1204 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm42938-201ENSMUST00000198414 1072 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 5930435M05Rik-202ENSMUST00000207936 414 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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