Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Ola1-203ENSMUST00000112055 1251 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Gm11371-201ENSMUST00000120294 385 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Gm2788-201ENSMUST00000129551 797 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Gm14401-204ENSMUST00000134614 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 4933431E20Rik-206ENSMUST00000138472 483 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Gm15392-201ENSMUST00000152863 778 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Gm23077-201ENSMUST00000157854 116 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Gm23187-201ENSMUST00000175746 86 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Gm26784-201ENSMUST00000181666 410 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Gm8282-201ENSMUST00000187559 483 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Gm37425-201ENSMUST00000193184 432 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 1700113A16Rik-202ENSMUST00000197172 776 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Shisa5-207ENSMUST00000197483 534 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 9230114K14Rik-204ENSMUST00000199805 695 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Gm34583-203ENSMUST00000202586 454 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Gm43904-201ENSMUST00000204945 379 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Gm44892-201ENSMUST00000208595 488 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Gm45478-201ENSMUST00000209472 211 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Gm7419-201ENSMUST00000209962 925 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Gm45900-201ENSMUST00000211879 409 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Gm32515-201ENSMUST00000219396 350 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Olfr1471-201ENSMUST00000096203 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Olfr1197-201ENSMUST00000099815 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Fbxw21-203ENSMUST00000198076 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Gm45056-201ENSMUST00000208140 3462 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 4930545L23Rik-201ENSMUST00000138303 2502 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 9430034N14Rik-201ENSMUST00000193532 3785 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Frmpd4-202ENSMUST00000112146 8153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Il1f5-201ENSMUST00000028360 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Gm32647-202ENSMUST00000206579 3147 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Plp1-201ENSMUST00000033800 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Gm15228-201ENSMUST00000142044 3440 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Ap1g1-201ENSMUST00000034171 3692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Exoc4-201ENSMUST00000052266 4824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Adgrl2-220ENSMUST00000200543 5509 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Hdlbp-202ENSMUST00000170883 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Xiap-204ENSMUST00000115095 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Apobec3-202ENSMUST00000109620 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 D030068K23Rik-204ENSMUST00000212085 1351 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Dyrk1a-201ENSMUST00000023614 5754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Cyp4a14-201ENSMUST00000030487 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Amot-201ENSMUST00000112835 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Gm42973-201ENSMUST00000197913 3200 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 A730017C20Rik-201ENSMUST00000058633 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Ubl7-209ENSMUST00000216925 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 AC158799.1-204ENSMUST00000217441 1321 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Depdc5-204ENSMUST00000119705 7929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Apbb2-204ENSMUST00000159786 6333 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Gm12919-201ENSMUST00000119855 1594 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Psg21-202ENSMUST00000182128 2066 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Psg21-201ENSMUST00000094793 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Gm20768-201ENSMUST00000199527 2338 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Ints2-202ENSMUST00000108039 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Pcyt1b-201ENSMUST00000045898 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Olfr1293-ps-201ENSMUST00000102551 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 H2al2a-201ENSMUST00000105001 542 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Gm14180-201ENSMUST00000105066 78 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Gm15186-201ENSMUST00000119345 563 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Trav8-2-201ENSMUST00000130122 337 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 9630013K17Rik-201ENSMUST00000146915 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Acss2os-201ENSMUST00000148685 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Gm23762-201ENSMUST00000158348 106 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Gm2976-201ENSMUST00000160362 513 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Gm7244-201ENSMUST00000164658 455 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Gm24824-201ENSMUST00000175097 78 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Rps19-ps8-201ENSMUST00000180714 422 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Gm27001-201ENSMUST00000182252 936 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Gm9423-201ENSMUST00000183173 997 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 4930565D16Rik-201ENSMUST00000192777 1112 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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Hoxc11P31313 Olfr1486-ps1-201ENSMUST00000208835 220 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 4930579P08Rik-201ENSMUST00000218193 1227 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 AC134468.2-202ENSMUST00000222820 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 AC134869.2-201ENSMUST00000225788 421 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 AC158954.1-201ENSMUST00000228272 1006 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Gm10354-201ENSMUST00000096953 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Defb18-201ENSMUST00000097818 258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Olfr305-203ENSMUST00000213869 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Tnip3-201ENSMUST00000114236 3769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Hmg20a-201ENSMUST00000034879 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Zfp111-203ENSMUST00000086006 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Slc6a20a-203ENSMUST00000171647 3894 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Cnr1-202ENSMUST00000084736 5761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Olfr1513-202ENSMUST00000215147 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Gm37548-201ENSMUST00000194519 3814 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Csde1-211ENSMUST00000198180 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxc11P31313 Gm3139-201ENSMUST00000178330 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Mrpl17-202ENSMUST00000124482 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Plb1-205ENSMUST00000202201 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm45904-201ENSMUST00000213082 2330 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Osbpl6-202ENSMUST00000111929 8257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 BB031773-201ENSMUST00000148892 3655 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Selp-205ENSMUST00000162746 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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