Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 AC158981.1-201ENSMUST00000226943 1205 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RxraP28700 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm37161-201ENSMUST00000191994 2697 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RxraP28700 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxraP28700 Hipk3-203ENSMUST00000111125 3651 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm14280-201ENSMUST00000138080 1444 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxraP28700 AC166574.5-201ENSMUST00000227438 1432 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RxraP28700 Zfp599-201ENSMUST00000086281 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxraP28700 Tmem161b-201ENSMUST00000057495 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxraP28700 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxraP28700 F2rl2-201ENSMUST00000022182 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxraP28700 Glrx-201ENSMUST00000022082 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxraP28700 Mbd4-202ENSMUST00000122816 2415 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxraP28700 Nup93-202ENSMUST00000109547 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gucy1b2-201ENSMUST00000022501 2711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm43483-201ENSMUST00000196724 2860 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 CT025639.1-201ENSMUST00000223906 1375 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm43022-201ENSMUST00000197067 4268 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 Pecam1-207ENSMUST00000183610 3006 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 Scn1a-202ENSMUST00000094951 5946 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gcnt2-202ENSMUST00000069958 3929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm10376-201ENSMUST00000100694 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 Trappc1-202ENSMUST00000102601 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 Iglv1-201ENSMUST00000103746 391 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 Mgst1-202ENSMUST00000118091 1030 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm13690-201ENSMUST00000118989 285 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 Mgst1-203ENSMUST00000120230 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 Plxna4os3-202ENSMUST00000143328 277 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm7991-201ENSMUST00000168668 591 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm6536-201ENSMUST00000171180 615 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 Scnm1-201ENSMUST00000172572 1054 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm7393-201ENSMUST00000172650 739 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 C430002N11Rik-202ENSMUST00000189067 1029 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 Ly6g-202ENSMUST00000190262 941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 Chil5-203ENSMUST00000200146 1296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm18484-201ENSMUST00000204389 991 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 Olfr97-202ENSMUST00000207414 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 A330076H08Rik-203ENSMUST00000208822 1164 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm36435-201ENSMUST00000213341 1178 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 CT030709.2-201ENSMUST00000215521 399 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 Akr1c21-201ENSMUST00000021628 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 Akr1c12-201ENSMUST00000021632 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 AC159462.2-201ENSMUST00000217559 463 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 AC211878.5-201ENSMUST00000221697 409 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm8616-201ENSMUST00000222175 1037 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 AC159205.2-201ENSMUST00000223759 816 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 Mrpl42-201ENSMUST00000075829 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm6807-201ENSMUST00000077435 888 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 Vmn1r30-202ENSMUST00000226334 1946 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 AC122263.1-201ENSMUST00000228636 2805 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 Sorbs2-207ENSMUST00000130011 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 Exoc2-201ENSMUST00000021785 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 AC123705.1-201ENSMUST00000222512 2058 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 Ppp3cc-203ENSMUST00000228911 1836 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 Spag9-203ENSMUST00000075695 6910 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 Frs2-201ENSMUST00000020381 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 Adam28-203ENSMUST00000224039 2638 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm37410-201ENSMUST00000193623 3039 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 Wdr63-201ENSMUST00000160285 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm30698-201ENSMUST00000214789 3198 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 4930545L23Rik-201ENSMUST00000138303 2502 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 Rfc1-201ENSMUST00000172732 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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RxraP28700 Tsr1-201ENSMUST00000045807 3389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RxraP28700 Elovl6-201ENSMUST00000071402 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RxraP28700 Ncoa4-202ENSMUST00000163336 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gja5-201ENSMUST00000072600 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RxraP28700 Akr1e1-202ENSMUST00000110691 3288 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm1698-201ENSMUST00000136749 2313 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RxraP28700 Spta1-201ENSMUST00000027817 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RxraP28700 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RxraP28700 Dctn4-204ENSMUST00000223984 2948 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RxraP28700 Wdr20-201ENSMUST00000095410 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RxraP28700 AC159195.2-201ENSMUST00000223670 3757 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RxraP28700 Strada-203ENSMUST00000106867 3386 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm22439-201ENSMUST00000104048 132 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RxraP28700 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RxraP28700 Klra7-204ENSMUST00000112013 1104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm14480-201ENSMUST00000118521 433 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm14791-201ENSMUST00000119061 1166 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RxraP28700 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RxraP28700 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm24893-201ENSMUST00000122745 369 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm10086-201ENSMUST00000136334 354 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RxraP28700 Scgb1b28-ps-201ENSMUST00000163647 290 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RxraP28700 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm17750-201ENSMUST00000182477 529 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RxraP28700 1700029B22Rik-202ENSMUST00000186532 694 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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