Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 4930567K20Rik-203ENSMUST00000220108 646 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Prl2c2-203ENSMUST00000221612 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prim1P20664 AC163631.1-201ENSMUST00000225041 598 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Prim1P20664 AC113031.6-202ENSMUST00000228468 1145 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Rab3b-201ENSMUST00000003502 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gm5619-201ENSMUST00000071172 760 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gm8444-201ENSMUST00000092020 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Adcy9-202ENSMUST00000117801 4507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gm38236-201ENSMUST00000192661 3229 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Ptbp3-210ENSMUST00000173699 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Nt5dc1-201ENSMUST00000047885 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Plppr1-201ENSMUST00000076670 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gm28898-201ENSMUST00000189604 2167 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Olfr1198-202ENSMUST00000215179 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prim1P20664 AC155929.3-201ENSMUST00000217963 1428 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Psg20-201ENSMUST00000076677 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Dnajc8-202ENSMUST00000094657 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Tiam1-201ENSMUST00000002588 7290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gja10-202ENSMUST00000219644 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Crebbp-205ENSMUST00000205765 7749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Nup133-201ENSMUST00000044795 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Ankrd45-202ENSMUST00000111608 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Atp6ap2-201ENSMUST00000033313 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gm16130-201ENSMUST00000153106 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Pramel-201ENSMUST00000118979 1383 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gm13310-201ENSMUST00000120962 1381 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prim1P20664 2310005A03Rik-201ENSMUST00000142569 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gm42895-201ENSMUST00000200761 2996 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Tet3-202ENSMUST00000089622 10904 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Bcas3-205ENSMUST00000108061 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Erc2-205ENSMUST00000210135 6233 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Zfand4-210ENSMUST00000223495 1751 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prim1P20664 AC125074.1-201ENSMUST00000227970 1331 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Pnpla1os-201ENSMUST00000146779 3946 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prim1P20664 G730013B05Rik-201ENSMUST00000180509 2176 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prim1P20664 A630001O12Rik-201ENSMUST00000212914 2182 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Itgb2l-202ENSMUST00000113773 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Il5ra-201ENSMUST00000167925 1704 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Olfr243-202ENSMUST00000215723 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Lamb3-201ENSMUST00000016315 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prim1P20664 AC154522.1-201ENSMUST00000224647 1903 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Trbv19-201ENSMUST00000103276 566 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Arhgdib-203ENSMUST00000111892 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gm15175-201ENSMUST00000117629 132 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gm6275-201ENSMUST00000118971 1122 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gm12599-201ENSMUST00000120534 792 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gm23212-201ENSMUST00000122718 60 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prim1P20664 D830026I12Rik-201ENSMUST00000124434 935 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Lypd8-201ENSMUST00000013787 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gm2892-201ENSMUST00000145537 711 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gm6803-201ENSMUST00000178301 435 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gm2056-201ENSMUST00000178852 435 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gm8332-201ENSMUST00000179468 435 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gm2035-201ENSMUST00000180053 435 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Rpl31-ps25-201ENSMUST00000181557 379 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gm28418-201ENSMUST00000186179 423 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gm5981-201ENSMUST00000199912 487 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gm44427-201ENSMUST00000204123 456 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Olfr737-ps1-201ENSMUST00000205382 283 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gm30400-202ENSMUST00000210562 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gm45283-201ENSMUST00000210593 628 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prim1P20664 AC124399.1-201ENSMUST00000218334 590 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gm2022-201ENSMUST00000220585 435 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prim1P20664 AC142227.1-201ENSMUST00000221371 621 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Samt4-201ENSMUST00000026029 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Magea4-201ENSMUST00000048675 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Sprr3-201ENSMUST00000058142 1222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Ocm-202ENSMUST00000085704 330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Obp1a-201ENSMUST00000088201 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Cacna1c-206ENSMUST00000185345 6579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Prokr1-203ENSMUST00000204682 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gria3-209ENSMUST00000165288 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Nr6a1-201ENSMUST00000076275 5941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gm15083-201ENSMUST00000138670 1413 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Plcg2-201ENSMUST00000081232 4298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Cd36-201ENSMUST00000082367 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Pcdh15-241ENSMUST00000195531 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Kat6b-207ENSMUST00000182855 6791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Tmem108-201ENSMUST00000049452 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Tex24-201ENSMUST00000095375 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Trim12a-202ENSMUST00000106837 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Ascc3-206ENSMUST00000219226 1357 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Itgam-205ENSMUST00000120355 3701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Golga1-201ENSMUST00000039165 4869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Slc2a9-205ENSMUST00000129099 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm9903-201ENSMUST00000181102 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Olfr1199-204ENSMUST00000213138 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gabrb2-201ENSMUST00000007797 3989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Anpep-202ENSMUST00000107392 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 4930402H05Rik-201ENSMUST00000203115 2829 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Dysf-203ENSMUST00000113818 6571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Adam22-202ENSMUST00000050166 8969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Sptbn1-202ENSMUST00000011877 8238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Adgrl2-208ENSMUST00000197567 5585 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm42848-201ENSMUST00000201477 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm23835-201ENSMUST00000104439 132 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms