Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
DmdP11531 Gm35037-201ENSMUST00000203144 506 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
DmdP11531 Stxbp4-202ENSMUST00000107872 2529 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
DmdP11531 Gm37906-201ENSMUST00000192050 3035 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
DmdP11531 Olfr669-203ENSMUST00000214260 2336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
DmdP11531 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
DmdP11531 Ncoa7-209ENSMUST00000216172 2026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
DmdP11531 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
DmdP11531 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
DmdP11531 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
DmdP11531 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
DmdP11531 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
DmdP11531 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
DmdP11531 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
DmdP11531 Mir3085-201ENSMUST00000175493 89 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
DmdP11531 Gm27024-201ENSMUST00000182561 755 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
DmdP11531 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
DmdP11531 Gm28482-201ENSMUST00000189350 452 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
DmdP11531 Gm37358-201ENSMUST00000195492 479 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
DmdP11531 Gm43724-201ENSMUST00000197516 226 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
DmdP11531 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
DmdP11531 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
DmdP11531 Olfr107-201ENSMUST00000077008 1033 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
DmdP11531 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
DmdP11531 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
DmdP11531 Sgo1-201ENSMUST00000024736 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
DmdP11531 4930404I05Rik-201ENSMUST00000125902 2675 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
DmdP11531 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
DmdP11531 Aldh1l1-203ENSMUST00000130418 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
DmdP11531 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
DmdP11531 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
DmdP11531 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
DmdP11531 Gm44704-201ENSMUST00000208963 1990 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
DmdP11531 Stk38l-201ENSMUST00000001675 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
DmdP11531 Clasp2-207ENSMUST00000214522 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
DmdP11531 Ighv1-16-201ENSMUST00000103501 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
DmdP11531 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
DmdP11531 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
DmdP11531 Gm25603-201ENSMUST00000158361 105 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
DmdP11531 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
DmdP11531 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
DmdP11531 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
DmdP11531 Svs1-201ENSMUST00000037696 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
DmdP11531 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
DmdP11531 BC106179-201ENSMUST00000055369 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
DmdP11531 Gm42898-201ENSMUST00000200370 3073 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
DmdP11531 D830026I12Rik-203ENSMUST00000151170 1607 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
DmdP11531 Frmpd1-201ENSMUST00000044773 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
DmdP11531 Cdh9-201ENSMUST00000026432 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
DmdP11531 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
DmdP11531 Gm26289-201ENSMUST00000104169 131 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
DmdP11531 Gm13451-201ENSMUST00000117649 592 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
DmdP11531 Nudt12os-202ENSMUST00000152750 849 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
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DmdP11531 Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
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DmdP11531 Tug1-202ENSMUST00000144852 4720 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
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DmdP11531 4930452L12Rik-201ENSMUST00000220158 785 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
DmdP11531 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
DmdP11531 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
DmdP11531 Gm40841-202ENSMUST00000222823 3989 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.36
DmdP11531 Tec-203ENSMUST00000113594 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
DmdP11531 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
DmdP11531 Rps6ka6-201ENSMUST00000065976 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
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DmdP11531 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
DmdP11531 Prr5l-209ENSMUST00000163762 4159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
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DmdP11531 Gm37870-201ENSMUST00000192349 1499 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
DmdP11531 Gm37467-202ENSMUST00000192785 1499 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
DmdP11531 Gm37252-201ENSMUST00000195063 1499 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
DmdP11531 Gm38013-202ENSMUST00000195453 1499 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
DmdP11531 Gm37286-201ENSMUST00000195885 1499 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
DmdP11531 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
DmdP11531 Mup19-202ENSMUST00000107477 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
DmdP11531 Gm9529-201ENSMUST00000177598 579 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
DmdP11531 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
DmdP11531 Gm29454-201ENSMUST00000190805 393 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
DmdP11531 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
DmdP11531 Gm17824-201ENSMUST00000197690 805 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
DmdP11531 AC164618.3-201ENSMUST00000224863 681 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms