Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Mup3-203ENSMUST00000107488 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Churc1-202ENSMUST00000110399 535 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Gm12225-201ENSMUST00000117995 298 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Gm13501-201ENSMUST00000118477 979 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Gm2003-201ENSMUST00000118537 636 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Gm15443-201ENSMUST00000118947 820 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Gm4773-201ENSMUST00000120392 702 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Gm1989-201ENSMUST00000126244 636 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 A130030D18Rik-201ENSMUST00000128608 654 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 0610037L13Rik-212ENSMUST00000135454 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Gm12861-201ENSMUST00000145395 681 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Gm11551-201ENSMUST00000147438 410 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Gm16260-201ENSMUST00000155141 304 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Gm23497-201ENSMUST00000157738 130 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Gm24498-201ENSMUST00000158445 102 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Gm24050-201ENSMUST00000158623 290 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Gm15775-201ENSMUST00000159796 538 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Sult3a2-201ENSMUST00000165904 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 4930579O11Rik-202ENSMUST00000168243 672 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Gm22132-201ENSMUST00000175316 100 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Gm24754-201ENSMUST00000177997 107 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Gm6113-201ENSMUST00000180319 639 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Calm5-201ENSMUST00000183198 589 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Gm27022-201ENSMUST00000183225 715 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Trav6d-4-202ENSMUST00000183820 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Gm28935-201ENSMUST00000185737 568 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Gm28609-201ENSMUST00000186515 463 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Atp5g3-201ENSMUST00000018914 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 1700124L16Rik-203ENSMUST00000190077 1110 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Gm37982-201ENSMUST00000193076 561 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Gm37716-201ENSMUST00000193553 947 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Gm8896-201ENSMUST00000197434 1106 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Gm8686-201ENSMUST00000203028 388 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Fxyd7-202ENSMUST00000206341 620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Gm34368-201ENSMUST00000209512 1111 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Gm36849-201ENSMUST00000210345 680 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 AL935138.1-201ENSMUST00000215309 196 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Gm26564-201ENSMUST00000216701 378 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Gm34304-201ENSMUST00000218927 1139 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Lilr4b-211ENSMUST00000219661 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Gm32300-201ENSMUST00000221735 515 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 AC134462.1-201ENSMUST00000223047 552 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Sult3a2-202ENSMUST00000223295 930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 AC166822.2-201ENSMUST00000228746 275 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Prap1-201ENSMUST00000026540 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Cst13-201ENSMUST00000046589 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Olfr672-201ENSMUST00000050599 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Olfr998-201ENSMUST00000052307 1012 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Olfr1489-201ENSMUST00000053113 1111 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Spink10-201ENSMUST00000055725 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Tceal8-201ENSMUST00000060101 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Mill2-202ENSMUST00000072415 1075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 1700010B08Rik-201ENSMUST00000073081 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Olfr698-201ENSMUST00000074981 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Vmn1r229-201ENSMUST00000076759 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Olfr507-201ENSMUST00000080014 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Olfr1029-201ENSMUST00000082191 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Mir185-201ENSMUST00000083530 65 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Gm10155-201ENSMUST00000084598 483 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Gm10029-201ENSMUST00000089635 330 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Gm10247-201ENSMUST00000090395 333 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Olfr1141-201ENSMUST00000099846 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Gm13881-201ENSMUST00000149025 3716 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Gm37403-201ENSMUST00000193775 3521 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Mxi1-203ENSMUST00000111737 4843 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Gm30382-202ENSMUST00000199007 1801 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Olfr975-202ENSMUST00000216647 2848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Gm21977-201ENSMUST00000163725 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Gm8068-201ENSMUST00000167440 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 AC149294.7-201ENSMUST00000227475 1432 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Gm37552-201ENSMUST00000193939 2520 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Gas2l3-201ENSMUST00000099374 6748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Akr1c20-201ENSMUST00000078239 1317 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Gm10822-201ENSMUST00000181596 2320 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Glmn-203ENSMUST00000100949 1759 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Vmn1r196-203ENSMUST00000227516 5122 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 4933424H11Rik-201ENSMUST00000200511 2018 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Gm10419-204ENSMUST00000198585 4059 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Vmn1r5-203ENSMUST00000228276 3188 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 1810013D15Rik-203ENSMUST00000196971 1450 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Ccdc60-201ENSMUST00000050178 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Magea5-201ENSMUST00000069556 1360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Heatr1-201ENSMUST00000059270 6780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Zfp438-201ENSMUST00000063989 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Emsy-201ENSMUST00000038359 3564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Il1bos-202ENSMUST00000156601 2425 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Wdr27-206ENSMUST00000228330 2759 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Anapc15-210ENSMUST00000144207 3103 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Olfr1181-202ENSMUST00000102619 1240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Trav12-1-201ENSMUST00000103650 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Gm25232-201ENSMUST00000104502 132 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Lypd8-202ENSMUST00000108826 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Spata48-202ENSMUST00000109678 753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Gm5915-201ENSMUST00000116136 454 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
P10404 Gm13750-201ENSMUST00000117621 465 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms