Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm5431-202ENSMUST00000109210 2971 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm14158-201ENSMUST00000118409 308 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm14016-201ENSMUST00000119095 486 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm12123-201ENSMUST00000120348 472 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm14990-201ENSMUST00000122354 445 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm24893-201ENSMUST00000122745 369 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 4930594O21Rik-202ENSMUST00000144981 682 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm11444-201ENSMUST00000146433 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm24883-201ENSMUST00000158391 281 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm3326-201ENSMUST00000164656 1043 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Rps19-ps6-201ENSMUST00000181233 438 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 6530411M01Rik-201ENSMUST00000181618 1033 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm37678-201ENSMUST00000192908 1146 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 1700094M23Rik-201ENSMUST00000197695 695 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Olfr311-203ENSMUST00000216473 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 AC160635.1-201ENSMUST00000216731 474 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 AC133948.2-201ENSMUST00000217850 378 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm46231-201ENSMUST00000220152 314 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 CT030166.4-201ENSMUST00000220640 404 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Mylf-ps-201ENSMUST00000222174 421 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm22504-201ENSMUST00000082963 139 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Snora21-201ENSMUST00000082967 137 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Kirrel3os-201ENSMUST00000066604 3799 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 4930550L24Rik-202ENSMUST00000118305 1684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gbp11-202ENSMUST00000171587 1329 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Lrrc46-201ENSMUST00000021251 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Crispld1-202ENSMUST00000159958 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Tnfaip6-201ENSMUST00000065927 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm44436-201ENSMUST00000204200 1494 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Vmn1r22-206ENSMUST00000228905 2394 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Trim75-201ENSMUST00000095295 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Rubcnl-201ENSMUST00000036072 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Cd200r4-202ENSMUST00000176321 2005 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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H2-Eb1P04230 AC121504.1-201ENSMUST00000221385 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 A630001G21Rik-202ENSMUST00000159122 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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H2-Eb1P04230 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Cd48-201ENSMUST00000015499 922 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm3208-201ENSMUST00000168281 427 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
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H2-Eb1P04230 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Etnppl-201ENSMUST00000072271 4468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Cep85l-201ENSMUST00000095691 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm13416-201ENSMUST00000117264 1612 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Rpe65-201ENSMUST00000029824 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Grip1-208ENSMUST00000138410 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Anxa1-201ENSMUST00000025561 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Psg18-201ENSMUST00000003597 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm9049-201ENSMUST00000178998 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm9030-201ENSMUST00000218405 2410 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm9029-201ENSMUST00000219232 2410 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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