Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Gm15736-201ENSMUST00000141710 420 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Rpl35a-ps3-201ENSMUST00000147311 333 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Rpl35a-ps6-201ENSMUST00000148282 333 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm13840-201ENSMUST00000149608 256 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm10552-202ENSMUST00000161763 717 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Polr3g-204ENSMUST00000161920 733 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 9430069I07Rik-201ENSMUST00000179647 336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm8883-202ENSMUST00000188258 545 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm29129-201ENSMUST00000191121 659 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm7369-201ENSMUST00000192738 936 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 1810049I09Rik-201ENSMUST00000205499 453 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm19092-201ENSMUST00000209036 969 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm45282-201ENSMUST00000209439 681 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm45478-201ENSMUST00000209472 211 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm7943-201ENSMUST00000212078 1034 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm19056-201ENSMUST00000218220 797 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 E130119H09Rik-201ENSMUST00000223176 978 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 AC158981.1-201ENSMUST00000226943 1205 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 9430069I07Rik-202ENSMUST00000227772 572 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Ly6g-201ENSMUST00000023246 336 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gja10-201ENSMUST00000056517 2117 ntAPPRIS P2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Olfr1287-201ENSMUST00000075390 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm10247-201ENSMUST00000090395 333 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Vmn1r198-201ENSMUST00000091733 903 ntAPPRIS P2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm6166-201ENSMUST00000098689 409 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Olfr1243-201ENSMUST00000099775 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 4930447M23Rik-202ENSMUST00000141289 1483 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Ldah-202ENSMUST00000169104 2626 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm2654-201ENSMUST00000221381 1592 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Chn1-202ENSMUST00000102677 3760 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 4632404H12Rik-202ENSMUST00000195940 4671 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Brox-201ENSMUST00000057062 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Carf-206ENSMUST00000180952 2157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Arhgef12-201ENSMUST00000072767 10059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Kcne4-202ENSMUST00000187432 1813 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm10693-201ENSMUST00000144146 2037 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Glyat-201ENSMUST00000044976 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Phc1-208ENSMUST00000160696 4213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Trdc-201ENSMUST00000196323 3865 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Adgrg6-203ENSMUST00000208429 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Mcm9-203ENSMUST00000219547 3168 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 9130409I23Rik-201ENSMUST00000036819 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Cyp2c29-202ENSMUST00000176624 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Redrum-201ENSMUST00000181269 1774 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Olfr399-202ENSMUST00000215915 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 4931403G20Rik-201ENSMUST00000180861 1699 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Fam205a1-201ENSMUST00000107979 4146 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Anks1b-201ENSMUST00000099364 1383 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Rpl36-ps7-201ENSMUST00000119462 315 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm13525-201ENSMUST00000120607 478 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm15644-201ENSMUST00000121764 387 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 1700061H18Rik-201ENSMUST00000139488 634 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm24422-201ENSMUST00000157800 119 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm19840-201ENSMUST00000169624 882 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm7651-201ENSMUST00000173398 901 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm2026-203ENSMUST00000174416 532 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 B230104I21Rik-201ENSMUST00000181143 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm27026-201ENSMUST00000183003 892 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm27218-201ENSMUST00000183745 392 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
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H2-M1F7CXU4 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm28150-201ENSMUST00000187305 614 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 1700054A03Rik-201ENSMUST00000187368 780 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm6472-202ENSMUST00000187973 582 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm28377-201ENSMUST00000189695 720 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm43950-201ENSMUST00000204767 996 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm29759-201ENSMUST00000205860 327 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm44590-201ENSMUST00000206161 391 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm44508-201ENSMUST00000206943 1157 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Olfr1345-ps1-201ENSMUST00000210627 244 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 AC118476.2-201ENSMUST00000215206 757 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 CT030175.1-201ENSMUST00000220822 408 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 AC154461.5-201ENSMUST00000225429 774 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 AC117949.1-201ENSMUST00000225547 419 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Olfr384-201ENSMUST00000072993 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Olfr1012-201ENSMUST00000099916 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm29502-201ENSMUST00000185979 3739 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Glb1l2-201ENSMUST00000040398 3701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Phf6-202ENSMUST00000101587 3639 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Vmn2r41-201ENSMUST00000168807 3617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Slc25a53-203ENSMUST00000113070 3140 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm15638-203ENSMUST00000154775 2945 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm20752-201ENSMUST00000197341 2833 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm38218-201ENSMUST00000193555 4689 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Acod1-201ENSMUST00000022722 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Itga1-201ENSMUST00000061673 10967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Nos2-201ENSMUST00000018610 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 5430427O19Rik-201ENSMUST00000113976 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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