Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 AC154806.2-201ENSMUST00000227212 2385 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Zmat4-206ENSMUST00000207301 4207 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Atp8a1-207ENSMUST00000135930 8069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Rttn-201ENSMUST00000023828 7268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm43099-201ENSMUST00000198943 5241 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Zfp58-204ENSMUST00000171518 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Olfr1278-206ENSMUST00000216229 6819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Lrp2-201ENSMUST00000080953 15460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 4921504E06Rik-201ENSMUST00000062060 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm6999-201ENSMUST00000180427 2658 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm22374-201ENSMUST00000104583 132 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Defa-ps7-201ENSMUST00000117139 168 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Mgst1-202ENSMUST00000118091 1030 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm11903-201ENSMUST00000118958 727 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Mgst1-203ENSMUST00000120230 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm11343-201ENSMUST00000120579 599 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Ccdc142os-201ENSMUST00000125657 891 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm18808-201ENSMUST00000173316 462 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Scnm1-202ENSMUST00000173462 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm21877-201ENSMUST00000185640 694 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm18655-201ENSMUST00000214802 1090 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 AC163296.1-202ENSMUST00000218395 661 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 AC163296.1-201ENSMUST00000220004 1266 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Tbca-204ENSMUST00000220825 497 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm33489-201ENSMUST00000223171 673 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Olfr332-201ENSMUST00000180165 3426 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Phxr4-202ENSMUST00000216590 1391 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Mxi1-203ENSMUST00000111737 4843 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Mkl2-204ENSMUST00000149359 8295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 AC138221.1-201ENSMUST00000216180 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Zbtb6-201ENSMUST00000053098 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Zbtb18-202ENSMUST00000094276 4204 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Olfr859-203ENSMUST00000217280 9596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Malat1-201ENSMUST00000172812 6983 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm17167-201ENSMUST00000169242 5054 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 9430034N14Rik-201ENSMUST00000193532 3785 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Ripor2-204ENSMUST00000110383 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Fer1l6-203ENSMUST00000161028 5714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Etl4-206ENSMUST00000114608 6635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Ctnnd1-224ENSMUST00000111698 5850 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm12104-201ENSMUST00000120359 979 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm13430-201ENSMUST00000121366 288 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 4930527B05Rik-201ENSMUST00000141593 602 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm26183-201ENSMUST00000157685 139 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm16026-205ENSMUST00000162923 641 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm4340-201ENSMUST00000163113 807 ntAPPRIS ALT2 BASIC6□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm27178-201ENSMUST00000184962 340 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm28583-201ENSMUST00000188903 2141 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm37383-201ENSMUST00000191750 745 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm17834-201ENSMUST00000204322 891 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 4930455C13Rik-201ENSMUST00000218108 1018 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm40797-201ENSMUST00000219762 385 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm9267-201ENSMUST00000222831 404 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm21762-202ENSMUST00000225881 830 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Rfpl4-202ENSMUST00000179971 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm42969-201ENSMUST00000199858 3631 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm15880-201ENSMUST00000142678 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Slc8a1-203ENSMUST00000163680 2913 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Slc8a1-201ENSMUST00000086538 2913 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Map7d2-201ENSMUST00000043151 3087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm38099-201ENSMUST00000193280 3170 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Havcr1-202ENSMUST00000081819 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Prpf4b-201ENSMUST00000077853 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Cd160-202ENSMUST00000107074 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm7337-202ENSMUST00000181439 2655 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Taf1-206ENSMUST00000149274 5954 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 AC162181.1-201ENSMUST00000221643 3728 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Mobp-203ENSMUST00000111627 481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Rpl35a-203ENSMUST00000115076 519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm13545-201ENSMUST00000119044 482 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Olfr1017-ps1-201ENSMUST00000121263 664 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm15538-201ENSMUST00000121410 313 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm26729-201ENSMUST00000180744 352 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm27218-201ENSMUST00000183745 392 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Spink8-202ENSMUST00000198988 768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm43904-201ENSMUST00000204945 379 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 E230029C05Rik-204ENSMUST00000208266 875 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm34552-201ENSMUST00000223381 636 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Smim15-203ENSMUST00000224361 830 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Serpina1e-201ENSMUST00000085054 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm3591-201ENSMUST00000164408 1745 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 A730011C13Rik-202ENSMUST00000141787 1877 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Cep57l1-210ENSMUST00000190022 1949 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Cd209b-201ENSMUST00000084086 2039 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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