Protein–RNA interactions for Protein: B2RRF6

Znf518a, Zinc finger protein 518A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518aB2RRF6 BB031773-201ENSMUST00000148892 3655 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Olfr1360-202ENSMUST00000205788 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Ugt1a6b-201ENSMUST00000113137 2249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Abcg8-201ENSMUST00000045714 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Luzp1-203ENSMUST00000105849 7438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Bdnf-210ENSMUST00000111051 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Gas7-204ENSMUST00000108682 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Gm26541-201ENSMUST00000181866 3973 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Olfr766-ps1-201ENSMUST00000204515 2909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Gstm6-203ENSMUST00000106683 745 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Gm14018-201ENSMUST00000119042 455 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Gm8837-201ENSMUST00000161037 1107 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Gm26557-201ENSMUST00000180756 493 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Gm5694-201ENSMUST00000195648 641 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 1700015C17Rik-201ENSMUST00000197297 239 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Gm16571-202ENSMUST00000203839 585 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Gm44422-201ENSMUST00000204142 1025 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Fxyd1-212ENSMUST00000206305 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Gm5055-201ENSMUST00000215697 581 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Fam216b-201ENSMUST00000066437 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Gm13986-202ENSMUST00000148587 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Gm37496-201ENSMUST00000191930 2509 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Rad51b-203ENSMUST00000218039 2187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Slc5a6-206ENSMUST00000202556 3078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Mef2c-222ENSMUST00000199019 4441 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Prdm10-205ENSMUST00000215847 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Tmem43-201ENSMUST00000032183 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Gm21152-201ENSMUST00000190271 3483 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Adamts6-201ENSMUST00000065766 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Aebp2-201ENSMUST00000032359 5932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Smpd4-203ENSMUST00000090159 4565 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Naip1-204ENSMUST00000222155 5361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Slfn10-ps-202ENSMUST00000152760 2673 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 A330015K06Rik-201ENSMUST00000195489 4286 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 St6galnac1-201ENSMUST00000009732 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Prps2-201ENSMUST00000026839 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Vtcn1-201ENSMUST00000054791 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 AC153143.2-201ENSMUST00000220999 1804 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Copg1-202ENSMUST00000113607 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Gcm2-201ENSMUST00000021791 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Vmn1r-ps111-201ENSMUST00000121014 997 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Vmn1r208-201ENSMUST00000124841 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 4930527B05Rik-201ENSMUST00000141593 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Mir6973b-201ENSMUST00000184185 80 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Gm5260-201ENSMUST00000186157 949 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Gm37072-201ENSMUST00000194570 837 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Gm43576-201ENSMUST00000197937 871 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Gm17908-201ENSMUST00000205552 1256 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Gm3800-201ENSMUST00000221086 554 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 AC154806.1-203ENSMUST00000227370 1032 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Nup214-201ENSMUST00000065398 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Mep1a-202ENSMUST00000117137 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Gabpb1-201ENSMUST00000039978 1991 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Tgm3-201ENSMUST00000110299 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 8030451A03Rik-203ENSMUST00000141428 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Sirpb1c-204ENSMUST00000108352 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Pla2r1-201ENSMUST00000112525 7112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Nudt7-202ENSMUST00000073521 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Pfkfb1-202ENSMUST00000112713 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Mcm9-203ENSMUST00000219547 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Gm37962-201ENSMUST00000195535 2034 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Slco6b1-202ENSMUST00000178359 1778 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Insl5-202ENSMUST00000106869 438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Gm14733-201ENSMUST00000117680 133 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Gm14893-201ENSMUST00000117904 282 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Scgn-202ENSMUST00000142826 470 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Gm28023-201ENSMUST00000184556 60 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Gm27825-201ENSMUST00000184586 60 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Gm8241-201ENSMUST00000189286 816 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Gm39384-201ENSMUST00000213703 743 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Gm18305-201ENSMUST00000216532 2128 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 AC102139.1-201ENSMUST00000227000 251 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Rpl37a-201ENSMUST00000059980 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Opcml-202ENSMUST00000115243 6676 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Mpp7-201ENSMUST00000115869 4975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Tbx5-201ENSMUST00000018407 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Dusp3-203ENSMUST00000107173 4311 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Elf5-201ENSMUST00000028609 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf518aB2RRF6 Prepl-202ENSMUST00000171795 3830 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf518aB2RRF6 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf518aB2RRF6 Rbpj-208ENSMUST00000201912 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf518aB2RRF6 Ccdc141-207ENSMUST00000164114 6222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms