Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm5110-201ENSMUST00000203122 1063 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Olrf445-ps1-201ENSMUST00000204960 314 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 AC121788.1-201ENSMUST00000218514 1046 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 AC161586.1-201ENSMUST00000223232 547 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 AC125064.1-201ENSMUST00000225801 295 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Vmn1r50-201ENSMUST00000081706 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Gm25515-201ENSMUST00000083858 157 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Gm24695-201ENSMUST00000083877 83 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Mlip-210ENSMUST00000184322 2668 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Birc5-202ENSMUST00000093906 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Kat6b-207ENSMUST00000182855 6791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Tmem207-201ENSMUST00000165687 1538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Gm5493-201ENSMUST00000182063 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Wdr76-202ENSMUST00000099473 2315 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Zfp275-201ENSMUST00000033731 6376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Rimklb-206ENSMUST00000204731 3039 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Net1-202ENSMUST00000099946 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Gm7972-203ENSMUST00000209180 2184 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Gm37100-201ENSMUST00000193344 1353 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 4932411K12Rik-203ENSMUST00000210384 1351 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Arhgap32-206ENSMUST00000182802 5621 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Asb14-201ENSMUST00000090337 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Gm15715-201ENSMUST00000118032 283 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Gm12119-201ENSMUST00000136083 700 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Gm25459-201ENSMUST00000157953 114 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Gm36535-201ENSMUST00000198395 511 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 1700110I07Rik-201ENSMUST00000205487 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Stx3-206ENSMUST00000211047 870 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 AC163661.1-201ENSMUST00000216546 910 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Gm46203-201ENSMUST00000218130 478 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Olfr726-201ENSMUST00000072370 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Olfr1457-201ENSMUST00000075170 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 AC112142.1-203ENSMUST00000228670 2472 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Mef2a-204ENSMUST00000107476 4759 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Cast-207ENSMUST00000222588 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Ttc37-201ENSMUST00000091466 5381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Wdr76-204ENSMUST00000110603 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Olfr292-201ENSMUST00000080165 3211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Znfx1-202ENSMUST00000067584 4147 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Smcr8-202ENSMUST00000102667 3544 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Gm37549-201ENSMUST00000194096 4065 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Arhgdib-202ENSMUST00000111891 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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PtprtQ99M80 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Lrrc75aos1-201ENSMUST00000142492 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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PtprtQ99M80 4930448H16Rik-201ENSMUST00000159838 580 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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PtprtQ99M80 AC166352.1-201ENSMUST00000215483 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 AC153870.1-201ENSMUST00000219599 560 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
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PtprtQ99M80 Gm11808-201ENSMUST00000089430 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Ftx-203ENSMUST00000130063 4275 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Mstn-201ENSMUST00000027269 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 4930511E03Rik-201ENSMUST00000203778 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Slc12a3-205ENSMUST00000212134 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 4922502D21Rik-201ENSMUST00000051283 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Vwde-201ENSMUST00000054530 3979 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Gm26939-201ENSMUST00000177146 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Slc17a3-204ENSMUST00000166467 4336 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 5430420F09Rik-201ENSMUST00000194956 1799 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Gm44117-201ENSMUST00000204442 1758 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 B020014A21Rik-201ENSMUST00000217333 1938 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Nolc1-201ENSMUST00000165017 3634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Ccdc39-201ENSMUST00000029222 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Pkd1l3-203ENSMUST00000212537 6576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Rdh16-201ENSMUST00000071646 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Ttf2-201ENSMUST00000076941 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Tmigd3-201ENSMUST00000010279 900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Olfr50-201ENSMUST00000112950 1157 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Gm15422-201ENSMUST00000117453 541 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Gm15709-201ENSMUST00000118354 213 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Gm11343-201ENSMUST00000120579 599 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Gm14237-201ENSMUST00000122080 430 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Gm26086-201ENSMUST00000157902 263 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
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