Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Tmem87a-203ENSMUST00000110729 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Gm37382-201ENSMUST00000193032 1596 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Gm39321-203ENSMUST00000217090 1575 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Olfr1441-202ENSMUST00000214153 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Deup1-202ENSMUST00000115592 2918 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Mbd4-202ENSMUST00000122816 2415 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Polk-210ENSMUST00000222389 1404 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Olfr60-202ENSMUST00000210932 2383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Zim3-202ENSMUST00000203365 3226 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Igkv4-80-201ENSMUST00000103341 348 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Igkv8-30-201ENSMUST00000103378 368 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Iglv1-201ENSMUST00000103746 391 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Gm23484-201ENSMUST00000104178 131 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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Ercc8Q8CFD5 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Cnih1-202ENSMUST00000146629 789 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 9530046B11Rik-201ENSMUST00000149413 1157 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Casp12-204ENSMUST00000151332 1065 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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Ercc8Q8CFD5 Gm26801-201ENSMUST00000180591 1219 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Gm26662-201ENSMUST00000181129 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Mir6409-201ENSMUST00000184957 92 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 4931428L18Rik-203ENSMUST00000187659 423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Gm37724-201ENSMUST00000195240 1221 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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Ercc8Q8CFD5 Ghrl-207ENSMUST00000204533 323 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Gm30196-201ENSMUST00000208957 160 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Gm45356-201ENSMUST00000209274 823 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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Ercc8Q8CFD5 AC153793.1-201ENSMUST00000220956 1298 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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Ercc8Q8CFD5 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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Ercc8Q8CFD5 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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Ercc8Q8CFD5 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Olfr1241-202ENSMUST00000214743 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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Ercc8Q8CFD5 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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Ercc8Q8CFD5 Tmod2-206ENSMUST00000215036 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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Ercc8Q8CFD5 Impg2-204ENSMUST00000160116 3992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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Ercc8Q8CFD5 Hist2h2bb-201ENSMUST00000177113 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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Ercc8Q8CFD5 Gm37322-201ENSMUST00000193409 337 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Gm37273-201ENSMUST00000195132 539 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Gm42823-201ENSMUST00000197975 256 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Rps4x-ps-201ENSMUST00000199852 793 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 Gm2505-201ENSMUST00000200413 825 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 E230032D23Rik-202ENSMUST00000207959 451 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ercc8Q8CFD5 E230032D23Rik-203ENSMUST00000208797 856 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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