Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 RMST_1.1-213ENSMUST00000220288 792 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 AC154816.1-201ENSMUST00000222688 634 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm18619-201ENSMUST00000222722 1147 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 4930477G07Rik-202ENSMUST00000223195 947 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 AC154461.4-201ENSMUST00000224878 468 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Vmn1r37-201ENSMUST00000077482 909 ntAPPRIS P2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Klrk1-202ENSMUST00000095412 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Rhox4b-201ENSMUST00000096458 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6093-202ENSMUST00000222963 2163 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Vamp4-207ENSMUST00000155003 1428 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42630-201ENSMUST00000195908 3448 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Ace2-202ENSMUST00000112271 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29123-201ENSMUST00000185808 3657 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13416-201ENSMUST00000117264 1612 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm36933-201ENSMUST00000194945 3071 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Scyl3-203ENSMUST00000161908 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9877-201ENSMUST00000064271 2627 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 4930594C11Rik-201ENSMUST00000192316 2755 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 4921539H07Rik-201ENSMUST00000197200 2985 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 2610203C20Rik-204ENSMUST00000181214 3525 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Nlrp1a-202ENSMUST00000108518 3767 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Cntnap3-201ENSMUST00000091554 6344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Mir705-201ENSMUST00000102058 82 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Tceal7-201ENSMUST00000113116 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15123-201ENSMUST00000138988 339 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16093-201ENSMUST00000141455 392 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm18191-201ENSMUST00000174624 824 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7631-201ENSMUST00000196935 1100 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm18131-201ENSMUST00000199241 449 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8075-202ENSMUST00000223088 682 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 AC154687.1-201ENSMUST00000224875 677 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9801-201ENSMUST00000054860 408 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr195-201ENSMUST00000075381 995 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 n-R5s60-201ENSMUST00000083299 119 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5512-202ENSMUST00000220222 1522 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15950-201ENSMUST00000162902 1973 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Tsga10-208ENSMUST00000193669 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc28aQ8CEI3 AC121286.2-201ENSMUST00000218069 2470 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Rubcnl-201ENSMUST00000036072 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Birc6-223ENSMUST00000183224 14562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26981-201ENSMUST00000182453 3169 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc28aQ8CEI3 AC123954.1-201ENSMUST00000222404 3272 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Slc6a14-201ENSMUST00000033414 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc28aQ8CEI3 AC129085.2-201ENSMUST00000223763 2800 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Pik3c2g-215ENSMUST00000218528 2712 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1247-203ENSMUST00000216424 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Sell-203ENSMUST00000192047 5703 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Krit1-202ENSMUST00000171023 5582 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Fut9-201ENSMUST00000084770 12134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc28aQ8CEI3 4931403G20Rik-201ENSMUST00000180861 1699 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29617-206ENSMUST00000187759 1600 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28749-205ENSMUST00000187886 1600 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29000-208ENSMUST00000190932 1600 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Tex26-205ENSMUST00000201683 1456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Ighv1-82-201ENSMUST00000103549 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Iglv1-201ENSMUST00000103746 391 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc28aQ8CEI3 BC002163-201ENSMUST00000121906 319 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11739-201ENSMUST00000125269 723 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc28aQ8CEI3 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26197-201ENSMUST00000175033 115 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Nlrc3-204ENSMUST00000180200 3842 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42997-201ENSMUST00000196074 918 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc28aQ8CEI3 RMST_1.1-214ENSMUST00000220389 633 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5668-201ENSMUST00000220897 436 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc28aQ8CEI3 AC154747.4-202ENSMUST00000223826 852 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Msmb-201ENSMUST00000022464 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc28aQ8CEI3 AV026068-229ENSMUST00000225516 595 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Prss58-201ENSMUST00000063523 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Krtap8-1-201ENSMUST00000072280 579 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr384-201ENSMUST00000072993 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Mtm1-206ENSMUST00000114621 3257 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Ugt2b34-201ENSMUST00000031181 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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