Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Gm10307-201ENSMUST00000189839 1337 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 F930017D23Rik-202ENSMUST00000213342 2141 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Ccser1-201ENSMUST00000045522 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Galnt15-202ENSMUST00000164208 3563 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Gm28515-201ENSMUST00000189823 2530 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Meis2-205ENSMUST00000110907 3718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Tmem161b-201ENSMUST00000057495 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Trp63-205ENSMUST00000115306 4691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Ogfod1-203ENSMUST00000109556 5310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Bank1-201ENSMUST00000041577 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Ganab-201ENSMUST00000096246 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Enpep-201ENSMUST00000029658 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Serpinb8-201ENSMUST00000000514 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Gabpb2-202ENSMUST00000098873 8272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Gm29670-201ENSMUST00000190228 2491 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Cops2-202ENSMUST00000110462 1853 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Gm15448-201ENSMUST00000094911 1557 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Olfr1440-202ENSMUST00000213657 7588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Serpina3c-201ENSMUST00000085050 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Ighv14-1-201ENSMUST00000103463 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Fam107b-204ENSMUST00000115054 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Gm11864-201ENSMUST00000116179 1220 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Gm13196-201ENSMUST00000118297 379 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Gm9439-201ENSMUST00000119554 973 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Gm15153-201ENSMUST00000119867 274 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Gm26480-201ENSMUST00000122619 297 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Gm25178-201ENSMUST00000122633 325 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Gm12145-201ENSMUST00000142108 217 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Gm14097-201ENSMUST00000147868 470 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Gm11423-202ENSMUST00000152784 686 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Gm15624-202ENSMUST00000154953 713 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Gm23018-201ENSMUST00000177928 109 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Gm9999-202ENSMUST00000185832 335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Gm37669-201ENSMUST00000192184 820 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Gm43656-201ENSMUST00000197882 434 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Gm44943-201ENSMUST00000207254 300 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 D730003K21Rik-202ENSMUST00000217456 533 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 AC154361.1-201ENSMUST00000225694 745 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Hbb-bh1-201ENSMUST00000063957 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Vmn1r78-201ENSMUST00000078039 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Macrod2os2-201ENSMUST00000143227 3566 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Ncl-201ENSMUST00000027438 8202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Trip4-210ENSMUST00000179395 7055 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Gm14471-201ENSMUST00000141035 2358 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Dnah11-201ENSMUST00000084806 14072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Nrcam-201ENSMUST00000020939 4469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Sec24c-202ENSMUST00000223751 4196 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Sorbs2-207ENSMUST00000130011 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 AI506816-205ENSMUST00000199941 2804 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Gpbp1l1-201ENSMUST00000030460 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Gm45407-201ENSMUST00000209499 3676 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Vmn2r-ps159-202ENSMUST00000096792 2574 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 4930517E11Rik-201ENSMUST00000129584 1457 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Gm38009-201ENSMUST00000194884 3341 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Gm37783-201ENSMUST00000192025 1856 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Serpinb9-201ENSMUST00000006391 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Nup93-203ENSMUST00000211822 2674 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Gm29761-201ENSMUST00000215964 1939 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Gm21152-201ENSMUST00000190271 3483 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Adgb-204ENSMUST00000172530 5215 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 5031434C07Rik-202ENSMUST00000188014 3244 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Mlip-215ENSMUST00000185144 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Gip-201ENSMUST00000103156 607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Trav13n-4-201ENSMUST00000103634 267 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Gm13798-201ENSMUST00000118285 139 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Gm14727-201ENSMUST00000118526 525 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Gm12879-201ENSMUST00000120003 1182 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Gm12903-201ENSMUST00000121015 544 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Gm14721-201ENSMUST00000121381 525 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Gm12863-201ENSMUST00000155069 536 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Gm24422-201ENSMUST00000157800 119 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Gm22702-201ENSMUST00000175372 69 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Gm26910-201ENSMUST00000180450 698 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 1700022N22Rik-201ENSMUST00000180932 709 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Gm21292-202ENSMUST00000190329 1225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Gm24826-202ENSMUST00000197298 216 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Gm30735-201ENSMUST00000199488 726 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms