Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Rhox3h-201ENSMUST00000096457 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Tbp-211ENSMUST00000162505 12794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9874-202ENSMUST00000194957 1464 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Atp2b4-203ENSMUST00000125659 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13856-201ENSMUST00000126498 1742 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28906-201ENSMUST00000191371 1779 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Slc22a19-201ENSMUST00000025666 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28395-201ENSMUST00000187794 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28571-201ENSMUST00000188922 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Golph3l-202ENSMUST00000098861 2221 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 D5Ertd577e-202ENSMUST00000202481 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38009-201ENSMUST00000194884 3341 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Sncaip-206ENSMUST00000178678 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Ptpn13-201ENSMUST00000048957 7915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28173-201ENSMUST00000191190 1496 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp2r3a-202ENSMUST00000075941 6786 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gjc3-201ENSMUST00000077119 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm14893-201ENSMUST00000117904 282 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14746-201ENSMUST00000120309 741 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 4930412L05Rik-202ENSMUST00000146501 1241 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
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Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc170-202ENSMUST00000138112 3350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Nphp3-207ENSMUST00000194774 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
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Ccdc88cQ6VGS5 Odf2-204ENSMUST00000113756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Kif9-202ENSMUST00000084952 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
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Ccdc88cQ6VGS5 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm37627-201ENSMUST00000194585 615 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm34274-201ENSMUST00000195825 615 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44996-201ENSMUST00000208787 2980 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Pdilt-201ENSMUST00000033267 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
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