Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Olfr60-202ENSMUST00000210932 2383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 2010111I01Rik-202ENSMUST00000091560 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Arhgap21-210ENSMUST00000154230 6972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 A330015K06Rik-201ENSMUST00000195489 4286 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Parp8-201ENSMUST00000022239 3098 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 AL589871.1-201ENSMUST00000221299 3561 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Adgrl2-202ENSMUST00000106128 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Luzp1-203ENSMUST00000105849 7438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Sdr42e1-201ENSMUST00000037955 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Hipk2-205ENSMUST00000160962 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Cfb-206ENSMUST00000154526 2397 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm15750-201ENSMUST00000120970 616 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Vmn1r-ps111-201ENSMUST00000121014 997 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm22275-201ENSMUST00000122470 310 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Vmn1r208-201ENSMUST00000124841 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm25219-201ENSMUST00000157545 330 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm4956-202ENSMUST00000178869 672 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Scgb2b33-201ENSMUST00000187413 334 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm5694-201ENSMUST00000195648 641 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm43089-201ENSMUST00000199162 275 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 1600020E01Rik-208ENSMUST00000205028 329 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Fxyd1-212ENSMUST00000206305 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 AC131912.1-201ENSMUST00000217527 290 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 AC102139.1-201ENSMUST00000227000 251 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Tacc2-202ENSMUST00000059145 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Baz2a-203ENSMUST00000217851 8385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Rffl-203ENSMUST00000074515 4973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gabpb1-201ENSMUST00000039978 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Wipf3-205ENSMUST00000163746 4102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Cxcr2-202ENSMUST00000106899 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm28515-201ENSMUST00000189823 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Cxcl9-201ENSMUST00000113093 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Pbdc1-201ENSMUST00000033577 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Mettl14-202ENSMUST00000090371 7197 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Pik3cg-201ENSMUST00000053215 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Slirp-204ENSMUST00000161023 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Pkn2-210ENSMUST00000174422 2904 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Slit2-208ENSMUST00000173107 9960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Eif2ak4-206ENSMUST00000110874 5298 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Slc17a3-204ENSMUST00000166467 4336 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm26541-201ENSMUST00000181866 3973 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 3100003L05Rik-201ENSMUST00000130240 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Gm26820-201ENSMUST00000180764 1008 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Gm27299-201ENSMUST00000184593 103 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Gm38237-201ENSMUST00000193366 376 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Gm45044-201ENSMUST00000208078 396 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Gm39384-201ENSMUST00000213703 743 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Gm7252-201ENSMUST00000223284 456 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 AC154806.5-204ENSMUST00000228900 867 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Glyat-201ENSMUST00000044976 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Afap1l2-201ENSMUST00000111584 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Med23-201ENSMUST00000020159 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 BB031773-201ENSMUST00000148892 3655 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Rnf144b-202ENSMUST00000110111 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Olfr557-202ENSMUST00000215423 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Cwc22-201ENSMUST00000065889 3471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Nin-211ENSMUST00000222237 9919 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Olfr77-201ENSMUST00000057596 9649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Nae1-211ENSMUST00000162466 1735 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Stk26-202ENSMUST00000114887 3173 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 AC154270.2-201ENSMUST00000226755 2306 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Wdhd1-204ENSMUST00000187531 4260 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Trmt13-201ENSMUST00000041524 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Cdh23-204ENSMUST00000105463 10991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Gm14893-201ENSMUST00000117904 282 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Cfhr3-201ENSMUST00000170441 1022 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Scarletltr-201ENSMUST00000176950 305 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Gm44287-201ENSMUST00000203069 290 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Gm43867-201ENSMUST00000203860 525 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Gm5055-201ENSMUST00000215697 581 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Gm28704-201ENSMUST00000186589 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Gm29636-201ENSMUST00000188149 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Pcdh15-216ENSMUST00000131724 6322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Mrpl19-201ENSMUST00000032124 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Ebpl-201ENSMUST00000022494 10092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Olfr605-202ENSMUST00000215417 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Trdmt1-202ENSMUST00000124488 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Meis2-206ENSMUST00000110908 3697 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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