Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH7

Arhgef40, Rho guanine nucleotide exchange factor 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef40Q3UPH7 Nwd1-201ENSMUST00000093427 7840 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Gm10744-201ENSMUST00000220184 2706 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Bdnf-203ENSMUST00000111043 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Olfr342-202ENSMUST00000216275 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Gm37706-201ENSMUST00000195379 2765 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Tmem33-202ENSMUST00000160352 5322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Mcf2l-205ENSMUST00000110871 3401 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Gm44101-201ENSMUST00000203951 2221 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Gm2065-201ENSMUST00000194697 2757 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Siae-204ENSMUST00000215474 4947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Gm11462-201ENSMUST00000117749 562 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Gm11902-201ENSMUST00000118849 270 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Obox1-202ENSMUST00000172463 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Gm20432-201ENSMUST00000173716 250 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Gm27998-201ENSMUST00000184902 361 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 4930403P22Rik-201ENSMUST00000192234 713 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 AC157572.4-201ENSMUST00000228203 549 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Olfr735-201ENSMUST00000049729 1065 ntAPPRIS P2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Olfr702-201ENSMUST00000080899 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Wipf3-206ENSMUST00000172046 4204 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Ppp1r3b-202ENSMUST00000210337 4349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Herc3-202ENSMUST00000041401 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Vmn1r52-203ENSMUST00000227100 2307 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Mapk10-202ENSMUST00000112846 2617 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Rubcnl-201ENSMUST00000036072 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Chordc1-201ENSMUST00000001825 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Mpdz-216ENSMUST00000220807 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Etl4-203ENSMUST00000114604 4786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Gm805-201ENSMUST00000181667 3160 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Sptan1-205ENSMUST00000113719 8018 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Lhx4-201ENSMUST00000027740 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Efl1-206ENSMUST00000207868 1537 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Gm34121-201ENSMUST00000206188 1490 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Gm12148-201ENSMUST00000153791 292 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 CT025619.3-201ENSMUST00000216299 3267 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Gin1-201ENSMUST00000027571 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Atp6v0a1-202ENSMUST00000092663 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Calcr-202ENSMUST00000115622 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Cops2-202ENSMUST00000110462 1853 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Phf6-201ENSMUST00000078944 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Cysltr2-201ENSMUST00000044664 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Nolc1-201ENSMUST00000165017 3634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Slco6b1-201ENSMUST00000167383 2492 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Tnfrsf19-201ENSMUST00000111234 4051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Gm16726-201ENSMUST00000130184 892 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Gm23225-201ENSMUST00000158121 114 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Gm37148-201ENSMUST00000195097 716 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Arhgef40Q3UPH7 Gm6575-201ENSMUST00000222946 697 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 AC138765.3-201ENSMUST00000227981 423 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Olfr1157-201ENSMUST00000099841 4621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Tirap-201ENSMUST00000175765 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Olfr316-202ENSMUST00000215071 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Ergic2-208ENSMUST00000136008 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Cntnap4-202ENSMUST00000118171 4860 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Gpr35-203ENSMUST00000169198 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Prpf40a-201ENSMUST00000076313 7374 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Zfp229-201ENSMUST00000065871 4525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Olfr1285-202ENSMUST00000220153 1430 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Gm45645-201ENSMUST00000211470 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Nos2-201ENSMUST00000018610 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Myh4-202ENSMUST00000170942 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Bach2-207ENSMUST00000171600 8493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Gm22275-201ENSMUST00000122470 310 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Fthl17-ps3-201ENSMUST00000126259 513 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Gm22990-201ENSMUST00000175427 89 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Gm43555-201ENSMUST00000196588 310 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Gm44422-201ENSMUST00000204142 1025 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Gm44861-201ENSMUST00000208325 1220 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Gm36855-202ENSMUST00000216439 754 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 AC154640.1-202ENSMUST00000227828 496 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Arhgef40Q3UPH7 Angpt2-201ENSMUST00000033846 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms