Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Tph1-201ENSMUST00000049298 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm37906-201ENSMUST00000192050 3035 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Rasgrf1-202ENSMUST00000034912 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Dennd6a-203ENSMUST00000224111 2692 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm24986-201ENSMUST00000104452 132 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm9493-201ENSMUST00000104916 579 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Rpl35a-203ENSMUST00000115076 519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm22152-201ENSMUST00000116966 125 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm12400-201ENSMUST00000120915 1003 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm12593-201ENSMUST00000120981 743 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm12978-201ENSMUST00000121250 522 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm15092-201ENSMUST00000138467 574 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm13389-201ENSMUST00000142774 639 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Mgst2-203ENSMUST00000159554 486 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Clec2i-204ENSMUST00000160867 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Polr3g-204ENSMUST00000161920 733 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Clec2i-205ENSMUST00000162666 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm4340-201ENSMUST00000163113 807 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm24111-201ENSMUST00000175491 97 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm20702-201ENSMUST00000176181 460 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm13147-202ENSMUST00000177526 1173 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm26587-201ENSMUST00000180795 989 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 4930471M09Rik-201ENSMUST00000181849 1112 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Mir8095-201ENSMUST00000185103 129 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm7285-201ENSMUST00000198801 580 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 4930459L07Rik-201ENSMUST00000199751 420 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Olfr1294-201ENSMUST00000208334 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm45282-201ENSMUST00000209439 681 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 AC126043.1-201ENSMUST00000221304 1141 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm40853-201ENSMUST00000221342 582 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm34165-201ENSMUST00000222012 1174 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm9255-201ENSMUST00000223225 581 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Zfp874a-208ENSMUST00000225479 1092 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 AC122309.1-201ENSMUST00000226945 421 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Clec2i-201ENSMUST00000032519 1014 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 5530400C23Rik-201ENSMUST00000048459 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Olfr1494-201ENSMUST00000051768 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm1604a-201ENSMUST00000097422 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm37984-201ENSMUST00000191641 3733 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm28068-201ENSMUST00000190861 3503 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Olfr1508-202ENSMUST00000206520 5791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 A830010M20Rik-204ENSMUST00000112671 6756 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Csrnp3-201ENSMUST00000053910 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm38263-201ENSMUST00000195879 3059 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Mbnl1-211ENSMUST00000192807 2906 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Luzp1-202ENSMUST00000063021 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Zfp27-206ENSMUST00000172448 2460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm12919-201ENSMUST00000119855 1594 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm35850-201ENSMUST00000210956 4653 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 4933411E06Rik-201ENSMUST00000186016 1493 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Rgs4-201ENSMUST00000027991 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Osbpl9-201ENSMUST00000030288 2871 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm45645-201ENSMUST00000211470 1963 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 AC153729.1-201ENSMUST00000214055 2562 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Igkv2-137-201ENSMUST00000103302 501 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Igkv8-21-201ENSMUST00000103387 382 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm14444-202ENSMUST00000109070 1281 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Mobp-203ENSMUST00000111627 481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm15161-201ENSMUST00000117340 387 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm7129-201ENSMUST00000117402 997 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm12525-201ENSMUST00000125412 554 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
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Usp39Q3TIX9 1700001G01Rik-204ENSMUST00000153022 928 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm4835-201ENSMUST00000155839 972 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm26357-201ENSMUST00000158218 115 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 AI480526-201ENSMUST00000159072 957 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 1700129C05Rik-203ENSMUST00000162271 325 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
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Usp39Q3TIX9 Gm27595-201ENSMUST00000184579 112 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm4785-201ENSMUST00000191025 751 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm37480-201ENSMUST00000194795 550 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm43542-201ENSMUST00000199505 379 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm44061-201ENSMUST00000203962 1195 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Tmem156-206ENSMUST00000212640 1271 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 1700124M09Rik-201ENSMUST00000217047 305 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm32515-201ENSMUST00000219396 350 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 AC162183.1-201ENSMUST00000224843 472 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 AC154527.3-201ENSMUST00000225519 989 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 AC152394.1-201ENSMUST00000227360 1086 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Ifitm5-201ENSMUST00000026562 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Stap1-201ENSMUST00000031171 909 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Olfr609-201ENSMUST00000055787 965 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Reg1-201ENSMUST00000079926 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Olfr742-201ENSMUST00000089836 1120 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm10770-201ENSMUST00000099418 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Snhg17-209ENSMUST00000186993 3144 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm45528-201ENSMUST00000209854 3145 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Olfr212-203ENSMUST00000220134 2349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm26545-201ENSMUST00000181082 1746 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Serpina3a-203ENSMUST00000185595 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
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