Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm28487-202ENSMUST00000187894 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm29056-201ENSMUST00000187933 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm29074-203ENSMUST00000188026 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm28754-201ENSMUST00000188778 1493 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm28520-202ENSMUST00000189379 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm28963-202ENSMUST00000189567 1493 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm28519-203ENSMUST00000190126 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm29207-202ENSMUST00000190931 1493 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm28310-202ENSMUST00000191136 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm29646-202ENSMUST00000191146 1493 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm28762-203ENSMUST00000191259 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm28691-202ENSMUST00000191561 1493 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm38174-201ENSMUST00000191787 1494 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 AC126028.1-201ENSMUST00000226218 2123 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Unc13d-202ENSMUST00000106450 4046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gngt2-202ENSMUST00000100532 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Elavl2-206ENSMUST00000107116 1282 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Ccdc7b-203ENSMUST00000108745 1047 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Ppp1r1c-203ENSMUST00000111780 708 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Rps6-ps3-201ENSMUST00000118010 750 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm11984-201ENSMUST00000118142 766 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm8688-201ENSMUST00000118240 969 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm13640-201ENSMUST00000118445 264 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm14519-201ENSMUST00000118490 312 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Dnase1-202ENSMUST00000120009 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm12477-201ENSMUST00000121221 571 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Olfr334-ps1-201ENSMUST00000121252 892 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm15989-201ENSMUST00000121895 498 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 4933411O13Rik-202ENSMUST00000140815 370 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm16043-201ENSMUST00000160030 616 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm17234-201ENSMUST00000172128 392 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Vdac2-208ENSMUST00000172727 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm27588-201ENSMUST00000185096 263 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm28142-201ENSMUST00000186899 698 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm38281-201ENSMUST00000192301 315 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm4856-201ENSMUST00000192696 1091 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm37004-201ENSMUST00000193021 683 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gimd1-202ENSMUST00000196701 654 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm34144-201ENSMUST00000197039 259 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm33626-201ENSMUST00000206790 828 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm44773-201ENSMUST00000207374 557 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm44743-201ENSMUST00000209062 386 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm4536-201ENSMUST00000209157 542 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm45408-201ENSMUST00000211080 390 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 4930555F03Rik-205ENSMUST00000212179 1257 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 AC124585.1-201ENSMUST00000213334 953 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 CU024910.1-201ENSMUST00000214310 418 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 AC158630.1-201ENSMUST00000214387 993 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm4804-203ENSMUST00000222542 577 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm36862-202ENSMUST00000222758 1051 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 AC125350.5-201ENSMUST00000226102 517 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 CT030662.2-201ENSMUST00000226942 805 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Plac8-202ENSMUST00000097437 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm10805-201ENSMUST00000099710 399 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Olfr1271-201ENSMUST00000099751 918 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Atxn7l1-210ENSMUST00000144586 3042 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Rhpn2-202ENSMUST00000085556 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm34921-201ENSMUST00000219528 1406 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm35208-201ENSMUST00000221590 1411 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Rgs7-201ENSMUST00000027812 1418 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Peg13-201ENSMUST00000202826 4725 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Grip1-215ENSMUST00000148954 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Zfp74-201ENSMUST00000032797 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Adgrg1-201ENSMUST00000093271 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Unc13d-201ENSMUST00000075036 3967 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 AC154323.3-201ENSMUST00000226927 1660 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Rmdn2-201ENSMUST00000040368 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Trim2-205ENSMUST00000107693 5755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
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Rpusd2Q149F1 Ctnnd1-209ENSMUST00000111678 5870 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Frk-202ENSMUST00000170771 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Rpusd2Q149F1 Gm37429-201ENSMUST00000193807 1799 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
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Rpusd2Q149F1 Gm37870-201ENSMUST00000192349 1499 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm37467-202ENSMUST00000192785 1499 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm37252-201ENSMUST00000195063 1499 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm38013-202ENSMUST00000195453 1499 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm37286-201ENSMUST00000195885 1499 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm44850-201ENSMUST00000205621 1329 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Zfp809-205ENSMUST00000215618 1313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm31614-201ENSMUST00000215504 3231 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Lrrc1-201ENSMUST00000113421 2630 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Rnase6-202ENSMUST00000226194 2452 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Ctbp2-214ENSMUST00000169570 3604 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm30340-201ENSMUST00000191898 2198 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 AC154355.1-201ENSMUST00000224604 2162 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Cd99l2-201ENSMUST00000037391 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Faf2-203ENSMUST00000126071 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Cdh23-205ENSMUST00000105464 11090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Zfp451-202ENSMUST00000044455 11876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm13058-201ENSMUST00000117097 1435 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm15533-202ENSMUST00000206216 3262 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Trav15n-1-201ENSMUST00000103590 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm26014-201ENSMUST00000104405 132 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm23946-201ENSMUST00000104423 197 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
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