Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm30698-201ENSMUST00000214789 3198 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Magea5-202ENSMUST00000169540 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Gm44704-201ENSMUST00000208963 1990 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Snrpb2-201ENSMUST00000008477 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Peak1-204ENSMUST00000188142 7524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Gm11758-202ENSMUST00000107327 1325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Exoc2-201ENSMUST00000021785 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Pdgfd-203ENSMUST00000214892 2862 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm16973-202ENSMUST00000180752 1972 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm18313-201ENSMUST00000221036 1784 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm24986-201ENSMUST00000104452 132 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm13414-201ENSMUST00000117516 727 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm13137-201ENSMUST00000118035 345 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm24057-201ENSMUST00000158616 302 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm7393-201ENSMUST00000172650 739 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Obox4-ps36-201ENSMUST00000177206 723 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Obox4-ps16-201ENSMUST00000177624 1137 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r-ps78-201ENSMUST00000178185 924 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Obox4-ps17-201ENSMUST00000178341 1137 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm4956-202ENSMUST00000178869 672 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Obox4-ps18-201ENSMUST00000179441 1137 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Mir378d-201ENSMUST00000184232 110 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm28413-201ENSMUST00000189369 291 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm36945-201ENSMUST00000192040 864 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm37977-201ENSMUST00000193096 721 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm22149-202ENSMUST00000196259 137 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 5033403H07Rik-202ENSMUST00000198248 756 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm43812-202ENSMUST00000202701 581 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm44577-201ENSMUST00000207413 1284 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm7789-201ENSMUST00000210473 701 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm34654-201ENSMUST00000217012 535 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 AC127224.1-201ENSMUST00000218094 453 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm1965-202ENSMUST00000161362 2405 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Sox5-214ENSMUST00000170367 7184 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Olfr1441-203ENSMUST00000216506 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Nr2c1-203ENSMUST00000105290 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Mapre2-202ENSMUST00000115830 2496 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Olfr845-203ENSMUST00000215572 3446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm15509-201ENSMUST00000162615 2162 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 5430427O19Rik-201ENSMUST00000113976 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm29123-201ENSMUST00000185808 3657 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Skiv2l2-201ENSMUST00000022281 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Btnl10-202ENSMUST00000069941 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm37653-201ENSMUST00000195401 3578 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gen1-201ENSMUST00000166117 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Crispld1-202ENSMUST00000159958 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Phc1-208ENSMUST00000160696 4213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm37410-201ENSMUST00000193623 3039 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm19583-201ENSMUST00000202993 1366 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Clasp1-203ENSMUST00000165223 7207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Brd8-201ENSMUST00000003876 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Tll2-201ENSMUST00000025986 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm44769-201ENSMUST00000206120 2809 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Spag9-203ENSMUST00000075695 6910 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Slc35a5-202ENSMUST00000114600 679 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm8916-201ENSMUST00000119732 949 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm12879-201ENSMUST00000120003 1182 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm12477-201ENSMUST00000121221 571 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm7546-201ENSMUST00000146119 966 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm24647-201ENSMUST00000157112 113 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 4930526L06Rik-201ENSMUST00000181137 1022 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm26812-201ENSMUST00000181647 328 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Klra13-ps-203ENSMUST00000204367 850 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm7419-201ENSMUST00000209962 925 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 AC125405.2-201ENSMUST00000227862 383 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r37-201ENSMUST00000077482 909 ntAPPRIS P2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Gm25852-201ENSMUST00000082790 130 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Snora21-201ENSMUST00000082967 137 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Adgrg4-201ENSMUST00000096431 1137 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ttc39dQ0VF76 Muc5b-201ENSMUST00000165147 14964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms