Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

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Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm15311-201ENSMUST00000119682 282 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm15305-201ENSMUST00000120354 288 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm15750-201ENSMUST00000120970 616 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm12920-201ENSMUST00000121818 1186 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm23430-201ENSMUST00000122490 314 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm16249-201ENSMUST00000124055 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ttc21bQ0HA38 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm8607-201ENSMUST00000221864 431 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm7252-201ENSMUST00000223284 456 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 AC134917.2-201ENSMUST00000223354 124 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 AC132474.1-201ENSMUST00000214407 3686 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Ofcc1-201ENSMUST00000054635 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Slc2a9-203ENSMUST00000067886 3602 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Ank3-231ENSMUST00000182884 9963 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Depdc5-205ENSMUST00000120902 5195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ttc21bQ0HA38 Olfr62-202ENSMUST00000213189 2570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Zfp882-201ENSMUST00000110002 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Zfp292-201ENSMUST00000047950 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Smg7-201ENSMUST00000043560 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Tlr1-202ENSMUST00000197315 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Unc5c-204ENSMUST00000130636 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Angpt2-201ENSMUST00000033846 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Zfp655-205ENSMUST00000199322 4157 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm19325-201ENSMUST00000186238 3382 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Ahcyl2-203ENSMUST00000115238 5129 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Trim60-201ENSMUST00000048565 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Rfpl4-202ENSMUST00000179971 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Olfr1285-202ENSMUST00000220153 1430 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm15114-201ENSMUST00000112788 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Mcm4-201ENSMUST00000023353 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Ttc21bQ0HA38 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Zfp180-201ENSMUST00000068975 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Stat2-201ENSMUST00000085708 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Ttc21bQ0HA38 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm8058-201ENSMUST00000217247 587 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm7986-201ENSMUST00000221336 551 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 AC105324.1-201ENSMUST00000227844 386 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
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Ttc21bQ0HA38 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Ttc21bQ0HA38 Slc43a2-201ENSMUST00000042561 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Cfap58-201ENSMUST00000066308 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm37593-201ENSMUST00000191669 3254 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm36120-201ENSMUST00000214393 1734 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Slc37a3-201ENSMUST00000090243 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Alms1-205ENSMUST00000213058 11163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Myot-202ENSMUST00000115498 2087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm36401-201ENSMUST00000194255 2028 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm44763-201ENSMUST00000208287 2019 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Mir760-201ENSMUST00000103257 119 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 4930527B05Rik-201ENSMUST00000141593 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm14343-201ENSMUST00000154524 731 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Mir124-2hg-201ENSMUST00000185804 3844 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 4930403P22Rik-201ENSMUST00000192234 713 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm43748-201ENSMUST00000202329 1233 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 AC131912.1-201ENSMUST00000217527 290 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 AC154806.5-204ENSMUST00000228900 867 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Rps29-201ENSMUST00000037023 390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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