Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm12038-201ENSMUST00000117322 207 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm11686-201ENSMUST00000122397 333 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm15873-201ENSMUST00000123390 761 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm15416-201ENSMUST00000131080 442 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm26486-201ENSMUST00000158021 110 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Scarna17-201ENSMUST00000158064 79 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 1700071M16Rik-202ENSMUST00000167672 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Cyp2c53-ps-201ENSMUST00000175649 897 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Mir5623-201ENSMUST00000176631 70 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 1110032A03Rik-209ENSMUST00000177546 647 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Tdgf1-ps1-201ENSMUST00000179882 516 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm29015-201ENSMUST00000187147 207 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Ighv1-8-201ENSMUST00000192236 293 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Mir7230-201ENSMUST00000195977 56 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm31243-201ENSMUST00000197498 632 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm30301-201ENSMUST00000199474 652 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm42884-201ENSMUST00000200729 422 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm34474-201ENSMUST00000209645 356 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Ryk-ps1-201ENSMUST00000219713 235 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm45925-202ENSMUST00000219904 1136 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm35412-201ENSMUST00000220437 999 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm18114-201ENSMUST00000221780 523 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 AC211878.7-201ENSMUST00000222851 661 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 AC126554.3-201ENSMUST00000223131 493 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm21818-202ENSMUST00000225144 894 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Olfr600-201ENSMUST00000056222 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Tor1aip2-202ENSMUST00000065648 2529 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Vwc2l-201ENSMUST00000053922 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Ppip5k2-205ENSMUST00000171129 3425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Cep57l1-204ENSMUST00000186239 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Zc3h12b-201ENSMUST00000082183 2831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Nsa2-201ENSMUST00000073456 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm44530-201ENSMUST00000207920 3559 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Ank3-240ENSMUST00000183169 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm43343-201ENSMUST00000202454 1926 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Dnajc8-202ENSMUST00000094657 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Cdh17-202ENSMUST00000108303 3287 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Olfr488-202ENSMUST00000211508 4624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Olfr488-203ENSMUST00000215173 4605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Ankrd49-201ENSMUST00000034406 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Dnajc15-202ENSMUST00000226459 6193 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Lrrtm4-203ENSMUST00000126399 3050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Defb20-201ENSMUST00000109836 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Mrps18b-202ENSMUST00000113782 803 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Rpsa-ps3-201ENSMUST00000117789 876 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Smim24-202ENSMUST00000118206 949 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm11318-201ENSMUST00000118640 961 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Romo1-204ENSMUST00000119950 379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Rps14-203ENSMUST00000122279 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm25804-201ENSMUST00000122785 188 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Plxna4os3-201ENSMUST00000127668 269 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Irx2P81066 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm22388-201ENSMUST00000158194 248 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm23007-201ENSMUST00000158951 177 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm25306-201ENSMUST00000175288 117 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm3002-202ENSMUST00000178256 444 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Ighv2-9-1-201ENSMUST00000180013 369 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm2974-202ENSMUST00000180184 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm19402-201ENSMUST00000180297 801 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Mir6337-201ENSMUST00000184194 105 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm18058-201ENSMUST00000207385 492 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm44743-201ENSMUST00000209062 386 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm45274-201ENSMUST00000209938 647 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm33103-201ENSMUST00000212717 527 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Irx2P81066 AC164614.1-201ENSMUST00000216038 397 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Irx2P81066 3110083C13Rik-202ENSMUST00000224786 907 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Irx2P81066 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Ssbp1-201ENSMUST00000031971 1063 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Pla2g2a-201ENSMUST00000077582 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms