Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 4930565D16Rik-201ENSMUST00000192777 1112 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ggta1P23336 B230112G18Rik-201ENSMUST00000192979 851 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
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Ggta1P23336 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ggta1P23336 Gm43555-201ENSMUST00000196588 310 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ggta1P23336 Gm42650-201ENSMUST00000197038 575 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ggta1P23336 Gm44471-201ENSMUST00000197963 100 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ggta1P23336 Gm18593-201ENSMUST00000200754 1139 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ggta1P23336 Gm43122-201ENSMUST00000201752 354 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ggta1P23336 Gm7419-201ENSMUST00000209962 925 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
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Ggta1P23336 CT030709.2-201ENSMUST00000215521 399 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ggta1P23336 Odf3l1-202ENSMUST00000215694 1212 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ggta1P23336 CT030166.4-201ENSMUST00000220640 404 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ggta1P23336 Gm30239-201ENSMUST00000220776 780 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ggta1P23336 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
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Ggta1P23336 AC154692.1-202ENSMUST00000226632 1231 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
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Ggta1P23336 Npvf-201ENSMUST00000031853 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
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Ggta1P23336 CT010453.1-201ENSMUST00000226795 2201 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
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Ggta1P23336 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ggta1P23336 Map2-203ENSMUST00000114012 5119 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Ggta1P23336 Gm35439-201ENSMUST00000200051 4809 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Ggta1P23336 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Ggta1P23336 Gm14120-201ENSMUST00000129067 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Ggta1P23336 Gm30165-201ENSMUST00000218769 1961 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
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Ggta1P23336 Zbtb18-212ENSMUST00000195612 3790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
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Ggta1P23336 Dnase1l3-201ENSMUST00000026315 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ggta1P23336 Pfkfb2-204ENSMUST00000171479 3342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ggta1P23336 Coro2a-201ENSMUST00000030021 4112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
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Ggta1P23336 Mir455-201ENSMUST00000093594 82 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ggta1P23336 Fasl-201ENSMUST00000000834 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
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Ggta1P23336 Fbxl5-203ENSMUST00000114047 2762 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ggta1P23336 Rbms3-207ENSMUST00000164018 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
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Ggta1P23336 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ggta1P23336 Olfr930-202ENSMUST00000217208 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ggta1P23336 Cyp2c39-201ENSMUST00000025968 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ggta1P23336 Cd36-203ENSMUST00000169095 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ggta1P23336 Nyap2-203ENSMUST00000123285 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
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