Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Dnah1-201ENSMUST00000048603 12872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Gm42848-201ENSMUST00000201477 2022 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Pecam1-202ENSMUST00000080853 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Cypt1-202ENSMUST00000115422 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Gm14612-201ENSMUST00000121522 881 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Speer4c-202ENSMUST00000179506 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Gm43192-201ENSMUST00000198002 637 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Gm43945-201ENSMUST00000203595 754 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Gm44163-201ENSMUST00000205140 475 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Gm44613-202ENSMUST00000205962 691 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Gm31036-201ENSMUST00000212925 521 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Gm36855-202ENSMUST00000216439 754 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 AV026068-219ENSMUST00000224148 933 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 CT009711.2-201ENSMUST00000225352 934 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Morn5-201ENSMUST00000028256 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Olfr290-201ENSMUST00000073468 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Vmn1r83-201ENSMUST00000086229 996 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Olfr1427-201ENSMUST00000087825 938 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Adgrg4-201ENSMUST00000096431 1137 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Dock9-206ENSMUST00000212181 7368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Gm43982-201ENSMUST00000204995 1829 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Gm42759-201ENSMUST00000195915 2439 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Emsy-201ENSMUST00000038359 3564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Gabpb2-205ENSMUST00000136139 8661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Dixdc1-201ENSMUST00000034566 5709 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Olfr601-202ENSMUST00000210431 2266 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Tdrkh-202ENSMUST00000166032 5692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Serpinb1b-201ENSMUST00000016951 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Olfr472-201ENSMUST00000209670 5290 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Nos2-201ENSMUST00000018610 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Olfr1432-202ENSMUST00000207710 2068 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Ceacam2-202ENSMUST00000064862 3087 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Gm42648-201ENSMUST00000200774 2505 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Wdr66-206ENSMUST00000163092 4009 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Nr1i3-208ENSMUST00000155126 2980 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Mpdz-216ENSMUST00000220807 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Gm45873-201ENSMUST00000211865 1915 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Gm7970-201ENSMUST00000167615 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Gm8229-201ENSMUST00000168161 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Gpatch11-201ENSMUST00000170759 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Vmn1r70-203ENSMUST00000226255 4868 ntAPPRIS P2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Olfr1199-203ENSMUST00000131038 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Gm14741-201ENSMUST00000120777 1009 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Gm12593-201ENSMUST00000120981 743 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Gm44641-201ENSMUST00000152342 323 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Gm5694-201ENSMUST00000195648 641 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Gm36816-201ENSMUST00000204824 493 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Gm34809-201ENSMUST00000220510 1135 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Pcdh15-216ENSMUST00000131724 6322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Gm16508-201ENSMUST00000197066 2742 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Myo5c-201ENSMUST00000036555 6727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Casp14-202ENSMUST00000219237 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Gm9874-202ENSMUST00000194957 1464 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Ston1-201ENSMUST00000064035 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Palld-201ENSMUST00000034057 3566 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 4930551I15Rik-201ENSMUST00000219700 2143 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Hmgb1-201ENSMUST00000085546 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Mrpl35-201ENSMUST00000065103 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Kcnj15-201ENSMUST00000037154 5089 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Card6-201ENSMUST00000118365 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Olfr702-201ENSMUST00000080899 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 CT009530.1-201ENSMUST00000227348 2927 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Gm44802-201ENSMUST00000208026 1916 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Gm22256-201ENSMUST00000102291 107 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Gm25785-201ENSMUST00000104129 125 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 H3f3a-ps1-201ENSMUST00000119546 410 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Gm28807-201ENSMUST00000187799 471 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Igkv12-67-201ENSMUST00000197806 354 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 4930401C15Rik-201ENSMUST00000218300 865 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Gm9269-201ENSMUST00000221661 578 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Gm8607-201ENSMUST00000221864 431 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 AC137871.3-201ENSMUST00000226628 225 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Gm37829-201ENSMUST00000193864 2213 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 3632451O06Rik-202ENSMUST00000118129 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Gm6502-201ENSMUST00000086050 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Kbtbd8-201ENSMUST00000032107 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 A830010M20Rik-201ENSMUST00000060553 2439 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Ppp3r2-201ENSMUST00000029991 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Olfr60-202ENSMUST00000210932 2383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Zfp472-201ENSMUST00000039132 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Slc16a14-201ENSMUST00000027422 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Gm2694-201ENSMUST00000180700 2314 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 Erc1-210ENSMUST00000184864 5428 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Sptan1P16546 2900064K03Rik-201ENSMUST00000196567 3113 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms