Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Ankrd49-201ENSMUST00000034406 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm45056-201ENSMUST00000208140 3462 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm6729-201ENSMUST00000165173 1452 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Lipt1-201ENSMUST00000041621 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Fryl-201ENSMUST00000094700 9852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm38276-201ENSMUST00000192446 1343 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm37968-201ENSMUST00000195131 3201 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Spam1-202ENSMUST00000202331 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Masp2-201ENSMUST00000052060 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Fmo9-202ENSMUST00000148677 2462 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Olfr1215-202ENSMUST00000214809 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm11855-201ENSMUST00000121562 1869 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Zscan18-203ENSMUST00000210650 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Ifit3-201ENSMUST00000102825 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Zbed4-ps3-201ENSMUST00000187149 3244 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Atf2-201ENSMUST00000055833 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Cenpe-201ENSMUST00000062893 7910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Atrx-201ENSMUST00000101305 2903 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Zfp964-201ENSMUST00000169125 1416 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Pigc-202ENSMUST00000111594 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Olfr212-202ENSMUST00000218028 2291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Ifna14-201ENSMUST00000102808 570 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Igkv8-28-201ENSMUST00000103380 305 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm24986-201ENSMUST00000104452 132 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Cisd3-202ENSMUST00000107584 546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm12460-201ENSMUST00000117147 357 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm12365-201ENSMUST00000117931 568 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm8624-201ENSMUST00000118083 432 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm12611-201ENSMUST00000119452 1037 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm12773-201ENSMUST00000120134 587 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm13358-201ENSMUST00000121427 569 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm15668-201ENSMUST00000140506 678 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 1700023C21Rik-201ENSMUST00000143247 389 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Mllt3-208ENSMUST00000149357 794 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm11816-202ENSMUST00000149848 714 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Rpain-210ENSMUST00000167509 519 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm4781-201ENSMUST00000167995 781 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 A530083I20Rik-202ENSMUST00000180877 1022 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 1700022N22Rik-201ENSMUST00000180932 709 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm26662-201ENSMUST00000181129 548 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm28821-201ENSMUST00000185637 610 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm7560-201ENSMUST00000187748 873 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm5251-201ENSMUST00000188959 472 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm17867-201ENSMUST00000188981 391 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Olfr318-201ENSMUST00000189911 1026 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm42161-201ENSMUST00000196278 726 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm2287-201ENSMUST00000197417 1084 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm40319-201ENSMUST00000199785 481 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm5723-201ENSMUST00000203096 432 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm19172-201ENSMUST00000203170 1246 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm44252-201ENSMUST00000204187 330 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm44979-201ENSMUST00000206218 287 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm17995-201ENSMUST00000209266 530 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm36843-201ENSMUST00000209303 627 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 AC108846.4-201ENSMUST00000216783 341 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Smim15-203ENSMUST00000224361 830 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Ifitm5-201ENSMUST00000026562 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Arhgef38-201ENSMUST00000054105 814 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Cd40-203ENSMUST00000081310 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm26264-201ENSMUST00000083278 159 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Sry-201ENSMUST00000091178 1188 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Zfp263-207ENSMUST00000162207 2452 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 A830010M20Rik-203ENSMUST00000100951 4545 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm5361-201ENSMUST00000211041 1498 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Olfr1385-202ENSMUST00000214948 4412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Zfhx4-203ENSMUST00000175866 11287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Zfp420-201ENSMUST00000057652 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm6350-201ENSMUST00000195099 1339 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm45753-201ENSMUST00000116473 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Olfr1006-201ENSMUST00000099917 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm45061-201ENSMUST00000204395 2095 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 AC159193.3-201ENSMUST00000221902 2622 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Lbhd1-202ENSMUST00000187504 3164 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Trim30c-201ENSMUST00000106828 1716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm3591-201ENSMUST00000164408 1745 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Ctps2-201ENSMUST00000033727 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm3742-201ENSMUST00000220907 1391 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Tdrkh-202ENSMUST00000166032 5692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Kif4-ps-201ENSMUST00000184686 3665 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Birc2-202ENSMUST00000074246 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Olfr60-202ENSMUST00000210932 2383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Apbb1ip-201ENSMUST00000014290 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Kcnj15-207ENSMUST00000113861 3385 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm37730-201ENSMUST00000192432 2211 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Btf3l4-202ENSMUST00000102740 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms