Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm40614-201ENSMUST00000125161 1254 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 A630023P12Rik-202ENSMUST00000141420 495 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 E130215H24Rik-201ENSMUST00000145525 939 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Gm12863-201ENSMUST00000155069 536 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Gm23220-201ENSMUST00000158115 137 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Olfr331-202ENSMUST00000170501 957 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 S100a10-203ENSMUST00000170612 477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Vmn2r-ps52-201ENSMUST00000176211 612 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Vmn1r-ps141-201ENSMUST00000176293 753 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Snhg7-201ENSMUST00000181621 139 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Gm28126-201ENSMUST00000185286 356 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 4930533D04Rik-201ENSMUST00000185478 788 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 4930568A12Rik-201ENSMUST00000186117 498 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Scgb1b25-ps-201ENSMUST00000186419 415 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Gm28609-201ENSMUST00000186515 463 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Gm18800-201ENSMUST00000186588 637 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Gm28212-201ENSMUST00000187114 356 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Gm29568-201ENSMUST00000187884 356 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Gm29080-201ENSMUST00000188565 356 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Gm28944-201ENSMUST00000188946 356 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Gm28908-201ENSMUST00000189002 356 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 1700027F09Rik-201ENSMUST00000189767 767 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Gm29078-201ENSMUST00000190611 356 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Gm37247-201ENSMUST00000192549 730 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Gm37799-201ENSMUST00000194018 547 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Gm19035-202ENSMUST00000194575 959 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 4930557J02Rik-201ENSMUST00000202325 1075 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 1600020E01Rik-203ENSMUST00000204008 713 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Cd69-203ENSMUST00000204411 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Gm30771-201ENSMUST00000205683 737 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Gm20670-201ENSMUST00000206468 338 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Tmem147-206ENSMUST00000208169 537 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 AC132384.10-201ENSMUST00000217862 1204 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 BC042761-201ENSMUST00000218344 938 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 AC152946.3-201ENSMUST00000219424 280 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Gm34662-202ENSMUST00000220753 603 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Gm36862-202ENSMUST00000222758 1051 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 AC146596.1-201ENSMUST00000223507 223 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 AC163667.2-201ENSMUST00000223769 791 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Msmb-201ENSMUST00000022464 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 AC164294.1-201ENSMUST00000224682 688 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 AC154687.1-201ENSMUST00000224875 677 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 AC163631.1-201ENSMUST00000225041 598 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 AC166822.2-201ENSMUST00000228746 275 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Olfr331-201ENSMUST00000081743 975 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Ighv1-13-201ENSMUST00000095364 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Gm15907-201ENSMUST00000134284 2309 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Cyp2j8-201ENSMUST00000124729 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Gm10466-201ENSMUST00000101450 2466 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Fsbp-201ENSMUST00000180239 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Gm43611-201ENSMUST00000196656 4352 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Gm26569-201ENSMUST00000181968 1789 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Gm31410-201ENSMUST00000217302 4048 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Olfr204-202ENSMUST00000216261 5371 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Usp17lc-201ENSMUST00000079348 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 AC122828.2-201ENSMUST00000222511 2880 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 4632404H12Rik-202ENSMUST00000195940 4671 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 4930545L23Rik-201ENSMUST00000138303 2502 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Gm44901-201ENSMUST00000208157 3977 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Glrx-204ENSMUST00000223120 1333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Polr2b-201ENSMUST00000031167 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Olfr1564-202ENSMUST00000208645 5213 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 AC139941.2-201ENSMUST00000221565 1824 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Olfr693-202ENSMUST00000215541 4015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Dock7-202ENSMUST00000075836 6704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Spp1-205ENSMUST00000112748 1456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Gm37952-202ENSMUST00000192516 1497 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 C130083A15Rik-201ENSMUST00000205707 1460 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Sugt1-201ENSMUST00000054908 7392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Mir124-2hg-201ENSMUST00000185804 3844 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Sh3kbp1-202ENSMUST00000080394 2980 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Gm7842-201ENSMUST00000217691 1379 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 A530058O07Rik-201ENSMUST00000222059 3364 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 9130409I23Rik-201ENSMUST00000036819 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Slmap-201ENSMUST00000038522 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Nppb-201ENSMUST00000103231 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Wfdc2-202ENSMUST00000109344 429 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Gm15154-201ENSMUST00000117590 366 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Gm12034-201ENSMUST00000119032 399 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Gm14450-201ENSMUST00000119984 240 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Hmgn2-ps1-201ENSMUST00000120716 279 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Gm13674-201ENSMUST00000121276 823 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Gm2214-201ENSMUST00000121333 330 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Vpreb1P13372 4930555O08Rik-201ENSMUST00000122821 668 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms