Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 AC161595.1-201ENSMUST00000216389 1993 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Cd200r4-203ENSMUST00000176819 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Wdr35-202ENSMUST00000111113 4312 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 9630041A04Rik-201ENSMUST00000112841 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm11880-201ENSMUST00000117612 399 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Tecr-202ENSMUST00000163837 1272 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm7991-201ENSMUST00000168668 591 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm6536-201ENSMUST00000171180 615 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Mir6239-201ENSMUST00000183564 105 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm29435-201ENSMUST00000191310 689 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm5149-202ENSMUST00000199980 1250 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm3428-204ENSMUST00000214488 1020 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 AC159542.1-201ENSMUST00000218201 450 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 AC158535.1-201ENSMUST00000221487 769 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm9837-201ENSMUST00000057722 731 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Vmn1r37-201ENSMUST00000077482 909 ntAPPRIS P2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Ndufa9-201ENSMUST00000088194 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm15930-201ENSMUST00000156603 2037 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Myrfl-201ENSMUST00000048229 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 2310039L15Rik-202ENSMUST00000219492 3743 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm20043-201ENSMUST00000222267 2565 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Tmem232-202ENSMUST00000086722 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Olfr452-203ENSMUST00000215719 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Olfr1427-203ENSMUST00000216069 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm45290-201ENSMUST00000211177 3890 ntBASIC7□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Dab2-201ENSMUST00000078019 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Mrps25-203ENSMUST00000140438 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm29123-201ENSMUST00000185808 3657 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Zfp110-205ENSMUST00000168247 2499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Ptprz1-206ENSMUST00000202579 6871 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm10376-201ENSMUST00000100694 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm11257-201ENSMUST00000121313 315 ntBASIC7□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm11646-201ENSMUST00000135857 397 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Tbata-208ENSMUST00000143207 982 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm15843-201ENSMUST00000146593 529 ntBASIC7□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm15915-201ENSMUST00000147379 908 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm13017-201ENSMUST00000156409 400 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm16026-205ENSMUST00000162923 641 ntBASIC7□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Olfr443-ps1-201ENSMUST00000163240 915 ntBASIC7□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Mir6930-201ENSMUST00000183859 68 ntBASIC7□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 1700020D05Rik-201ENSMUST00000189704 1021 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm29566-201ENSMUST00000190627 457 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
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H2-Eb1P04230 Olfr440-ps1-201ENSMUST00000204044 917 ntBASIC7□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Cd69-203ENSMUST00000204411 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Olfr221-203ENSMUST00000214342 1062 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 5033421B08Rik-202ENSMUST00000219595 1194 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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H2-Eb1P04230 Olfr735-201ENSMUST00000049729 1065 ntAPPRIS P2 BASIC7□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Cldn34b2-201ENSMUST00000076671 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Vmn1r42-201ENSMUST00000089419 1098 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 B230118H07Rik-201ENSMUST00000090513 969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 St3gal6-202ENSMUST00000114358 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Trim30c-201ENSMUST00000106828 1716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 9930111J21Rik2-202ENSMUST00000101295 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm43181-201ENSMUST00000197001 2072 ntBASIC7□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 AC151984.1-201ENSMUST00000218261 2976 ntBASIC7□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Olfr510-202ENSMUST00000213979 2898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 3830408C21Rik-202ENSMUST00000223895 1689 ntBASIC7□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Piwil2-201ENSMUST00000048129 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Rslcan18-201ENSMUST00000091526 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm18632-201ENSMUST00000222597 2087 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Slfn10-ps-202ENSMUST00000152760 2673 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Cyp2c67-201ENSMUST00000067328 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm18830-201ENSMUST00000199036 1396 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Celf2-202ENSMUST00000100429 7491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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