Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Ikzf5-201ENSMUST00000046306 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm42885-201ENSMUST00000200763 4214 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Igkv4-81-201ENSMUST00000103340 290 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm10086-201ENSMUST00000136334 354 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm7546-201ENSMUST00000146119 966 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm14241-201ENSMUST00000151260 264 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Fcor-201ENSMUST00000159364 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm10552-202ENSMUST00000161763 717 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Klk1b7-ps-202ENSMUST00000183762 619 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm28573-201ENSMUST00000187821 380 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm28145-201ENSMUST00000189742 380 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm29566-201ENSMUST00000190627 457 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm28400-201ENSMUST00000191332 380 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 A930005N03Rik-201ENSMUST00000194920 1247 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm42580-201ENSMUST00000197223 753 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 5033403H07Rik-202ENSMUST00000198248 756 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 5033421B08Rik-202ENSMUST00000219595 1194 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 AC134468.2-202ENSMUST00000222820 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 AC146596.1-201ENSMUST00000223507 223 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Olfr473-201ENSMUST00000084761 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm11758-202ENSMUST00000107327 1325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Cd59a-203ENSMUST00000168176 1806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Vmn2r45-201ENSMUST00000164845 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Kmo-201ENSMUST00000040250 2695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm45470-201ENSMUST00000209685 7044 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Olfr1346-203ENSMUST00000215302 4525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm10466-201ENSMUST00000101450 2466 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm28515-201ENSMUST00000189823 2530 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Focad-201ENSMUST00000097992 5791 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 4930505O20Rik-201ENSMUST00000142188 1758 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm18313-201ENSMUST00000221036 1784 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Plac1-202ENSMUST00000114843 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm7129-201ENSMUST00000117402 997 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm11865-201ENSMUST00000118093 859 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm14727-201ENSMUST00000118526 525 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm14721-201ENSMUST00000121381 525 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 4933401B06Rik-202ENSMUST00000142024 1219 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm27019-201ENSMUST00000183056 404 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Mir378d-201ENSMUST00000184232 110 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Scgb2b8-ps-201ENSMUST00000188661 327 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Scgb2b13-ps-201ENSMUST00000190420 328 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm2762-203ENSMUST00000201658 1234 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gpr19-210ENSMUST00000203762 498 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm44931-201ENSMUST00000206056 545 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm46231-201ENSMUST00000220152 314 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm8616-201ENSMUST00000222175 1037 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 AC152940.1-201ENSMUST00000226504 139 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Olfr1364-201ENSMUST00000057453 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Vmn1r204-201ENSMUST00000091728 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Il22-201ENSMUST00000096691 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Tdrkh-205ENSMUST00000197495 2476 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm45753-201ENSMUST00000116473 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Tor1aip2-202ENSMUST00000065648 2529 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gpr119-201ENSMUST00000053970 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm37274-201ENSMUST00000192167 1682 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Lama2-201ENSMUST00000092639 9614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Brd8-201ENSMUST00000003876 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Dennd6a-203ENSMUST00000224111 2692 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm38070-201ENSMUST00000191850 6480 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm8232-201ENSMUST00000164277 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 T2-201ENSMUST00000163578 1755 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 AC135083.2-201ENSMUST00000228599 1456 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm43750-201ENSMUST00000199027 2493 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Dzank1-204ENSMUST00000163701 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Olfr1183-202ENSMUST00000213115 8258 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Scn1a-202ENSMUST00000094951 5946 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Macrod2os2-201ENSMUST00000143227 3566 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Olfr1173-202ENSMUST00000216887 5363 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Olfr115-203ENSMUST00000223366 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Vwa3a-205ENSMUST00000167213 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm43398-201ENSMUST00000196584 2742 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 AC153132.1-201ENSMUST00000222625 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm15739-201ENSMUST00000118049 872 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms