Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Kbtbd3-202ENSMUST00000212221 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Olfr615-203ENSMUST00000215673 3469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 4933408N05Rik-201ENSMUST00000139864 1584 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Zfp9-201ENSMUST00000161170 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Ska2-201ENSMUST00000020794 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Mmp20-201ENSMUST00000034487 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Wnk1-218ENSMUST00000161512 1426 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Dnajc8-202ENSMUST00000094657 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Paip1-202ENSMUST00000109203 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Rbmy-201ENSMUST00000100360 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Soat1-201ENSMUST00000051396 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Lifr-204ENSMUST00000226471 3392 ntAPPRIS P3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 AC160029.1-201ENSMUST00000219628 2678 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Vmn1r6-204ENSMUST00000227188 8185 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Etl4-202ENSMUST00000066509 7197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Mobp-203ENSMUST00000111627 481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Lyzl1-202ENSMUST00000120837 652 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Gm28053-201ENSMUST00000127537 350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Gm15092-201ENSMUST00000138467 574 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Gm14040-201ENSMUST00000139058 697 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 2310040G07Rik-202ENSMUST00000145897 462 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 1700060C16Rik-201ENSMUST00000150559 645 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Gm23094-201ENSMUST00000157551 322 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Gm16554-201ENSMUST00000159471 460 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Mup8-202ENSMUST00000163931 986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Gm3571-201ENSMUST00000170703 1060 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Vmn1r113-202ENSMUST00000173723 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Smarca2-204ENSMUST00000175791 946 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Gm6061-201ENSMUST00000175860 492 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Uchl1os-202ENSMUST00000177319 505 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 n-R5s115-201ENSMUST00000179019 119 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Ighv2-9-1-201ENSMUST00000180013 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Gm29007-201ENSMUST00000190633 679 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Gm31305-201ENSMUST00000198557 710 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Gm44173-201ENSMUST00000204316 132 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Gm3774-201ENSMUST00000209773 435 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Rps11-204ENSMUST00000211725 493 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 AC153937.2-202ENSMUST00000219583 670 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Gm7727-201ENSMUST00000219830 671 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Gm35412-201ENSMUST00000220437 999 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 D830013O20Rik-202ENSMUST00000221180 683 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 AC122877.1-201ENSMUST00000228873 218 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 n-R5s193-201ENSMUST00000082864 109 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Olfr659-201ENSMUST00000098170 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Gm42881-201ENSMUST00000198636 3344 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Gm38070-201ENSMUST00000191850 6480 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Gm15169-201ENSMUST00000126095 2753 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Fkbp15-202ENSMUST00000084528 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Ankrd55-205ENSMUST00000223871 3209 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Fam83b-202ENSMUST00000183437 3879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Gm44255-201ENSMUST00000203456 2053 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Osbpl9-213ENSMUST00000160271 2604 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Gm38105-201ENSMUST00000192112 2621 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Gm15232-201ENSMUST00000146929 2318 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Rfx3-201ENSMUST00000046898 4274 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Gm2080-201ENSMUST00000211299 1573 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Trp63-202ENSMUST00000065523 5257 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 AC153144.1-201ENSMUST00000221759 3139 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 AC124675.1-201ENSMUST00000226263 1390 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Myl7-201ENSMUST00000102921 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Gm24472-201ENSMUST00000104484 132 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Olfr1196-201ENSMUST00000104892 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Borcs8-202ENSMUST00000110139 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Tfpi-207ENSMUST00000111722 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Gm24382-201ENSMUST00000122698 107 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Gm11399-201ENSMUST00000131021 324 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Smim18J3QNP2 Gm25154-201ENSMUST00000157123 119 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms