Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm37891-201ENSMUST00000195585 1326 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 A730017C20Rik-201ENSMUST00000058633 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Mroh4-201ENSMUST00000023271 3583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Sspn-203ENSMUST00000111702 4415 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm37952-202ENSMUST00000192516 1497 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm18830-201ENSMUST00000199036 1396 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Wdr63-201ENSMUST00000160285 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm31410-201ENSMUST00000217302 4048 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm25631-201ENSMUST00000104390 130 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Cypt3-202ENSMUST00000112573 669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm14279-201ENSMUST00000117142 332 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Rpl35a-ps2-201ENSMUST00000117444 333 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm13414-201ENSMUST00000117516 727 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm10243-201ENSMUST00000117571 333 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm15644-201ENSMUST00000121764 387 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Rpl35a-ps4-201ENSMUST00000121779 333 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm12371-201ENSMUST00000144029 1091 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Rpl35a-ps3-201ENSMUST00000147311 333 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Rpl35a-ps6-201ENSMUST00000148282 333 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 9530046B11Rik-201ENSMUST00000149413 1157 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Atxn3-205ENSMUST00000161011 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm16027-201ENSMUST00000161618 758 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Tecr-202ENSMUST00000163837 1272 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm17032-201ENSMUST00000164367 338 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 1700054A03Rik-201ENSMUST00000187368 780 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm38079-201ENSMUST00000195603 154 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm2762-203ENSMUST00000201658 1234 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm44931-201ENSMUST00000206056 545 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm35998-201ENSMUST00000212862 838 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 AC151904.2-201ENSMUST00000218683 1177 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 AC147245.1-201ENSMUST00000223294 677 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 AC159205.2-201ENSMUST00000223759 816 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 AC157212.1-201ENSMUST00000228398 1075 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Olfr1502-201ENSMUST00000074221 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm10247-201ENSMUST00000090395 333 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 AC122356.1-202ENSMUST00000227328 2758 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Vmn1r51-201ENSMUST00000072859 2567 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Trdc-201ENSMUST00000196323 3865 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Lonrf2-201ENSMUST00000039612 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm43168-201ENSMUST00000201039 1612 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Srrm1-201ENSMUST00000030613 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Olfr1122-202ENSMUST00000215371 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Parp6-202ENSMUST00000050483 2631 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 4930545L23Rik-201ENSMUST00000138303 2502 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Parp8-201ENSMUST00000022239 3098 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Olfr691-202ENSMUST00000213290 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Cdh2-202ENSMUST00000115850 3785 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm6999-201ENSMUST00000180427 2658 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm37161-201ENSMUST00000191994 2697 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Zfp397-201ENSMUST00000060762 5472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm43533-201ENSMUST00000202933 2936 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Vmn1r197-202ENSMUST00000226225 5326 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Pcyt1b-201ENSMUST00000045898 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Crem-204ENSMUST00000122958 2254 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Ctage5-208ENSMUST00000175877 2612 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm43181-201ENSMUST00000197001 2072 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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Rrn3B2RS91 Ighv9-2-201ENSMUST00000103472 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Rrn3B2RS91 Mgst2-203ENSMUST00000159554 486 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Smarca2-213ENSMUST00000176698 955 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm26179-201ENSMUST00000177723 132 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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Rrn3B2RS91 1110002O04Rik-201ENSMUST00000194261 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm45432-201ENSMUST00000210391 416 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm35521-201ENSMUST00000211285 440 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 AC160114.3-201ENSMUST00000222256 560 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Olfr384-201ENSMUST00000072993 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Il1a-201ENSMUST00000028882 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm17491-201ENSMUST00000180411 2311 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Vmn2r57-201ENSMUST00000165029 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Slc38a6-202ENSMUST00000101313 1546 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 T2-201ENSMUST00000163578 1755 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gpr22-203ENSMUST00000176710 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Tmem87a-203ENSMUST00000110729 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Cspp1-217ENSMUST00000186294 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Zfp667-201ENSMUST00000086327 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Gm20043-201ENSMUST00000222267 2565 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rrn3B2RS91 Mcm4-201ENSMUST00000023353 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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