Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN8

Gm5114, MCG1026354, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5114W4VSN8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm5114W4VSN8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm5114W4VSN8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm5114W4VSN8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm5114W4VSN8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm5114W4VSN8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm5114W4VSN8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm5114W4VSN8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm5114W4VSN8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm5114W4VSN8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm5114W4VSN8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm5114W4VSN8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm5114W4VSN8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm5114W4VSN8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm5114W4VSN8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm5114W4VSN8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm5114W4VSN8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm5114W4VSN8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm5114W4VSN8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm5114W4VSN8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm5114W4VSN8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm5114W4VSN8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm5114W4VSN8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm5114W4VSN8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm5114W4VSN8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm5114W4VSN8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm5114W4VSN8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm5114W4VSN8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm5114W4VSN8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm5114W4VSN8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm5114W4VSN8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm5114W4VSN8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm5114W4VSN8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm5114W4VSN8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm5114W4VSN8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm5114W4VSN8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms