Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3550W4VSN7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms