Protein–RNA interactions for Protein: V9GX34

Csmd2, CUB and Sushi multiple domains 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd2V9GX34 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Csmd2V9GX34 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csmd2V9GX34 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csmd2V9GX34 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csmd2V9GX34 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csmd2V9GX34 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csmd2V9GX34 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Csmd2V9GX34 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csmd2V9GX34 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csmd2V9GX34 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csmd2V9GX34 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csmd2V9GX34 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csmd2V9GX34 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csmd2V9GX34 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csmd2V9GX34 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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