Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Top3bQ9Z321 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms