Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Hdac5Q9Z2V6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hdac5Q9Z2V6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hdac5Q9Z2V6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hdac5Q9Z2V6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hdac5Q9Z2V6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hdac5Q9Z2V6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hdac5Q9Z2V6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hdac5Q9Z2V6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Hdac5Q9Z2V6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hdac5Q9Z2V6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hdac5Q9Z2V6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hdac5Q9Z2V6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hdac5Q9Z2V6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hdac5Q9Z2V6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hdac5Q9Z2V6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hdac5Q9Z2V6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hdac5Q9Z2V6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hdac5Q9Z2V6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hdac5Q9Z2V6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hdac5Q9Z2V6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hdac5Q9Z2V6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hdac5Q9Z2V6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Hdac5Q9Z2V6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Hdac5Q9Z2V6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hdac5Q9Z2V6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Hdac5Q9Z2V6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Hdac5Q9Z2V6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Hdac5Q9Z2V6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms