Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Crlf3Q9Z2L7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms