Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd1Q9Z2E2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms