Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C4

Mtmr1, Myotubularin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr1Q9Z2C4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mtmr1Q9Z2C4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms