Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms