Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx39bQ9Z1N5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms