Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Skp2Q9Z0Z3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skp2Q9Z0Z3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms