Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I7

Slfn1, Schlafen 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn1Q9Z0I7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slfn1Q9Z0I7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Slfn1Q9Z0I7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Slfn1Q9Z0I7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slfn1Q9Z0I7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slfn1Q9Z0I7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slfn1Q9Z0I7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slfn1Q9Z0I7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slfn1Q9Z0I7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slfn1Q9Z0I7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slfn1Q9Z0I7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slfn1Q9Z0I7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slfn1Q9Z0I7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slfn1Q9Z0I7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slfn1Q9Z0I7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slfn1Q9Z0I7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slfn1Q9Z0I7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slfn1Q9Z0I7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slfn1Q9Z0I7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slfn1Q9Z0I7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slfn1Q9Z0I7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slfn1Q9Z0I7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slfn1Q9Z0I7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slfn1Q9Z0I7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Slfn1Q9Z0I7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slfn1Q9Z0I7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Slfn1Q9Z0I7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Slfn1Q9Z0I7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slfn1Q9Z0I7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slfn1Q9Z0I7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slfn1Q9Z0I7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slfn1Q9Z0I7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slfn1Q9Z0I7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slfn1Q9Z0I7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slfn1Q9Z0I7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slfn1Q9Z0I7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slfn1Q9Z0I7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slfn1Q9Z0I7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Slfn1Q9Z0I7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slfn1Q9Z0I7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slfn1Q9Z0I7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slfn1Q9Z0I7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms