Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0F7

Sncg, Gamma-synuclein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncgQ9Z0F7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncgQ9Z0F7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms